【发布时间】:2019-04-26 18:58:19
【问题描述】:
我正在尝试使用 matplotlib 中的 twiny() 从包含这些数据块的 XML 文件中绘制具有两个 x 轴的曲线:
<data>
<meas>
<utc>2018-11-10T22:27:06.500003</utc>
<ra_j2000>23.9722686269</ra_j2000>
<dec_j2000>-1.23845121893</dec_j2000>
<mag>9.96074403533</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T22:27:54.500002</utc>
<ra_j2000>23.9930913364</ra_j2000>
<dec_j2000>-1.03788334773</dec_j2000>
<mag>11.356437889</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T22:38:36.500002</utc>
<ra_j2000>0.267638646848</ra_j2000>
<dec_j2000>1.56055091433</dec_j2000>
<mag>11.1642458641</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T22:46:18.500000</utc>
<ra_j2000>0.462353662364</ra_j2000>
<dec_j2000>3.34334963425</dec_j2000>
<mag>11.1082534741</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T22:57:18.500001</utc>
<ra_j2000>0.740393528722</ra_j2000>
<dec_j2000>5.78641590694</dec_j2000>
<mag>11.0688955214</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T23:03:06.499995</utc>
<ra_j2000>0.888541738338</ra_j2000>
<dec_j2000>7.03265231497</dec_j2000>
<mag>10.2358937709</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T23:05:42.500002</utc>
<ra_j2000>0.955591973177</ra_j2000>
<dec_j2000>7.5832430461</dec_j2000>
<mag>10.86206725</mag>
</meas>
<meas>
<utc>2018-11-10T23:06:48.499999</utc>
<ra_j2000>0.984093767077</ra_j2000>
<dec_j2000>7.81466175077</dec_j2000>
<mag>10.3466108708</mag>
</meas>
</data>
我的问题是这些 x 轴上的值未对齐。这是我的 Python 脚本:
import math
import xml.etree.ElementTree as ET
from astropy.time import Time
from astropy.coordinates import get_sun
from datetime import datetime, timedelta
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.ticker as ticker
from matplotlib import dates
tree = ET.parse('20181110_10241.xml')
root = tree.getroot()
x_ut = []
x_phi = []
y_brightness = []
def convert_time(obs_time):
obs_time = str(obs_time)
d, t = obs_time.split('T')
year, month, day = map(int, d.split('-'))
hour, minute, second = t.split(':')
return datetime(year, month, day, int(hour), int(minute)) + \
timedelta(seconds=float(second))
def get_sun_coords(obs_time):
sun_coords = get_sun(obs_time)
sun_ra = sun_coords.ra.degree
sun_dec = sun_coords.dec.degree
return sun_ra, sun_dec
def get_phase_angle(sun_ra, sun_dec, target_ra, target_dec):
phase_angle = math.degrees(math.acos(-math.sin(math.radians(sun_dec))*math.sin(math.radians(target_dec)) - math.cos(math.radians(sun_dec))*math.cos(math.radians(target_dec))*math.cos(math.radians(sun_ra-target_ra))))
return phase_angle
for meas in root.findall('meas'):
obs_time = Time(meas.find('utc').text, format='isot', scale='utc')
target_ra = float(meas.find('ra_j2000').text)*15
target_dec = float(meas.find('dec_j2000').text)
mag = float(meas.find('mag').text)
sun_ra, sun_dec = get_sun_coords(obs_time)
phase_angle = get_phase_angle(sun_ra, sun_dec, target_ra, target_dec)
obs_time = convert_time(obs_time)
x_ut.append(obs_time)
x_phi.append(phase_angle)
y_brightness.append(mag)
fig, ax1 = plt.subplots()
ax1.plot(x_ut, y_brightness, marker='o', label='apparent brightness')
ax1.set_xlim(x_ut[0],x_ut[-1])
ax1.xaxis.set_major_locator(dates.MinuteLocator(interval=1))
ax1.xaxis.set_major_formatter(dates.DateFormatter('%H:%M'))
ax1.tick_params(axis='x', rotation=45)
ax1.minorticks_on()
ax1.legend()
ax1.grid()
ax1.set_xlabel('time [h:m, UT]')
ax1.set_ylabel('apparent brightness [mag, CR]')
ax2 = ax1.twiny()
ax2.plot(x_phi,y_brightness, marker='^', color='red')
ax2.set_xlim(x_phi[0],x_phi[-1])
ax2.xaxis.set_major_locator(ticker.MultipleLocator(1))
ax2.minorticks_on()
ax2.set_xlabel('phase angle (phi) [deg]')
plt.gca().invert_yaxis()
plt.tight_layout(pad=0)
plt.show()
这会产生以下情节:
我打算稍后隐藏红色曲线(通过使用visibility=False),在这里我绘制它只是为了查看x轴值的正确对齐,即实际上两条曲线必须(!)重叠,因为相位角 (x_phi) 值取决于相应的时间戳 (x_ut) 值,但您可以清楚地看到,只有开头和结尾正确对齐,但中间的大部分数据未对齐(相位曲线向右移动)。
我做错了什么?
最初,我猜想,相位角 (x_phi) 是随时间非线性变化的,因此两条曲线的 set_xlim() 拉伸它们的方式不同,但这不是真的,我绘制了 x_phi 反对x_ut 并且有明显的线性变化:
提前感谢您的帮助!
编辑: tel 在下面的回答中已经证明了非线性。因此,我稍微改变一下我的问题。
如果我从两个子图 ax1 和 ax2 中删除 set_xlim(),那么:
1) 上 x 轴自动反转,从最小值开始,虽然列表 x_phi 给出值,从最大值开始 - 我如何避免这种反转而不使用 invert_axis() ? (在不同的情况下,x_phi 列表中的值总是只会增加或减少)
2) 共有3个列表:x_ut、x_phi和y_brightness;我实际上只需要绘制曲线y_brightness 与x_ut,另外还要让x_phi(与ticker.MultipleLocator(1))的值与x_ut 的相应时间值对齐——我怎么能这样做?
我的问题与此类似: How do I align gridlines for two y-axis scales using Matplotlib? 但就我而言,上 x 轴的刻度之间没有线性间距,因此我无法使用该解决方案。
此外,这个问题涉及一个类似的问题:
trouble aligning ticks for matplotlib twinx axes
但在我的例子中,我不知道如何表达两个 x 轴之间的关系,因为数据类型非常不同:日期时间与浮点数。它们之间唯一的关系是一对一的,即x_ut的第一个值与x_phi的第一个值相关,第二个与第二个相关,以此类推;而且这种关系是非线性的。
EDIT 2:我之前的 EDIT 中的数字 1) 现在已解决。对于剩下的问题,看起来我必须使用register_scale() 才能相对于主 x 轴重新缩放辅助 x 轴。为此,我还必须定义matplotlib.scale.ScaleBase 的子类。到目前为止,我只发现了两个复杂的(对我而言)如何做到这一点的示例:
https://matplotlib.org/examples/api/custom_scale_example.html
https://stackoverrun.com/es/q/8578801(西班牙语,但代码中有英文 cmets)
我不确定我是否能够自己实现这个,所以我仍然寻求任何帮助。
【问题讨论】:
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如果你想在这里得到一个具体的答案,你可能想分享一个minimal reproducible example,人们可以使用它。
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@ImportanceOfBeingErnest 我现在添加了一个更大的底层 XML 示例,并在底部包含了关于非线性的结论。其他一切——我的 Python 脚本——都已完成。我仍然希望得到一些帮助...
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如果你想定义一个自定义比例,你需要一个将一个值映射到其他值的函数。由于您不知道此功能,因此您可以对这些值进行插值,例如使用
numpy.interp。
标签: python matplotlib alignment axes