从 GraphViz 保存序列树

【问题标题】：Saving sequence tree from GraphViz从 GraphViz 保存序列树
【发布时间】：2016-04-11 02:42:25
【问题描述】：

我是 TraMineR 和一般序列分析的新手。我正在开展一个与教育领导者的保留和招聘相关的项目，并发现 TraMineR 非常有用。这可能是一件简单的事情（而且有些不重要），但我似乎无法弄清楚如何命名或指导 GraphViz 在 TraMinR 包中创建的序列树。现在，我的代码是：

wardTree=as.seqtree(wardCluster,seqdata=retain.seq,diss=retain.dst,ncluster=15)
seqtreedisplay(wardTree,type="d",border=NA,showdepth=TRUE)

它生成了一个很棒的图形，但是如果我不小心关闭了图形，我无法重新定位它的随机文件名。

我的主要目标是能够对这些图表进行唯一命名和保存，并将其放入整个项目的 R Markdown 中。至此，我唯一不能加入的是 seqtree 图形。

【问题讨论】：

标签： r rstudio graphviz r-markdown traminer

【解决方案1】：

好吧，我猜我想通了！我没有意识到文件名命令的顺序很重要......所以......看起来很漂亮的是：

wardTree=as.seqtree(wardCluster,seqdata=retain.seq,diss=retain.dst,ncluster=15)
seqtreedisplay(wardTree,type="d",border=NA,showtree=TRUE,showdepth=TRUE,filename="retaintree.png",imageformat="png")

为了将文件合并到 Markdown 中，我使用命令

```    
![](C:\Users\myname\Desktop\retaintree.png)    
```{r fig.width=8.5, fig.height=11}

希望这可以帮助其他人！

【讨论】：

并且，假设path 指向一个现有文件夹，您可以通过声明filename="path/retaintree.png" 来控制目标目录。