让 XHProf 可视化（Graphviz 和 dot 的问题）工作

Question

我安装了XHProf 并希望看到调用图可视化。我点击View Full Callgraph 并首先收到以下消息：

执行 cmd 失败：“dot -Tpng”。 stderr: `sh: dot: command not found '

经过一番谷歌搜索，我发现这是由于未安装Graphviz引起的。然后我安装了它：

$ yum install graphviz

然后再试一次。现在我收到以下错误消息：

执行 cmd 失败：“dot -Tpng”。标准错误：`错误：/usr/lib64/graphviz/config6 大小为零，或其他读取错误。

错误：/usr/lib64/graphviz/config6 大小为零，或其他读取错误。

“点”不支持布局引擎

也许需要运行“dot -c”（使用安装程序的权限）来注册插件？

'

确实执行dot -c 会导致错误：

$ dot -c
Error: /usr/lib64/graphviz/config6 is zero sized, or other read error.
Warning: Could not load "/usr/lib64/graphviz/libgvplugin_pango.so.6" - file not found
Warning: Could not load "/usr/lib64/graphviz/libgvplugin_xlib.so.6" - file not found
Segmentation fault

但是文件libgvplugin_pango.so.6 和libgvplugin_xlib.so.6 在那里并且位于/usr/lib64/graphviz/：

$ ls -l /usr/lib64/graphviz
total 724
...
lrwxrwxrwx 1 root root     26 May 19 13:58 libgvplugin_pango.so.6 -> libgvplugin_pango.so.6.0.0
-rwxr-xr-x 1 root root  22408 Sep 19  2012 libgvplugin_pango.so.6.0.0
lrwxrwxrwx 1 root root     25 May 19 13:58 libgvplugin_xlib.so.6 -> libgvplugin_xlib.so.6.0.0
-rwxr-xr-x 1 root root  15656 Sep 19  2012 libgvplugin_xlib.so.6.0.0

好吧，作为符号链接。但这应该没关系。反正我也测试过这个案例：

mv /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_pango.so.6 /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_pango.so.6_DEACT
mv /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_xlib.so.6 /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_xlib.so.6_DEACT
cp /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_pango.so.6.0.0 /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_pango.so.6
cp /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_xlib.so.6.0.0 /usr/lib64/graphviz/libgvplugin_xlib.so.6

没有效果，还是一样的错误。

这里出了什么问题以及如何使它工作？

环境：VirtualBox VM 使用 CentOS 6 作为客户系统。

Answer 1

我终于搞定了。

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简答：

我猜想 yum update 或/以及 ann-libs 安装 可能是决定性的步骤 (-s)。但这只是一个假设，因此我描述了所有可能很重要的步骤（如下所示）。

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详细解答：

首先我尝试使用相关软件包安装graphviz：

$ yum install 'graphviz*'

但是安装没有成功：

Error: php56w-common conflicts with php-common-5.3.3-46.el6_6.x86_64
 You could try using --skip-broken to work around the problem
** Found 1 pre-existing rpmdb problem(s), 'yum check' output follows:
cairo-1.8.8-3.1.el6.x86_64 has missing requires of libpixman-1.so.0()(64bit)

然后我尝试了相同的方法，但之前将graphviz-rhel.repo 添加到了存储库中：

$ cd /etc/yum.repos.d/
$ wget http://www.graphviz.org/graphviz-rhel.repo
$ yum list available 'graphviz*'
$ yum install 'graphviz*'

由于另一个错误而失败：

Error: Package: graphviz-2.38.0-1.el6.x86_64 (graphviz-stable)
           Requires: libANN.so.1()(64bit)
 You could try using --skip-broken to work around the problem
** Found 1 pre-existing rpmdb problem(s), 'yum check' output follows:
cairo-1.8.8-3.1.el6.x86_64 has missing requires of libpixman-1.so.0()(64bit)

正如预期的那样，--skip-broken 也没有成功。

之后我做了很多事情：yum clean all、yum erase 'graphviz*'、ann-libs 安装和yum update：

$ yum clean all
$ yum install 'graphviz*'
$ yum erase 'graphviz*'
$ cd ~/temp/
$ wget http://dl.fedoraproject.org/pub/epel/6/x86_64/ann-libs-1.1.1-4.el6.x86_64.rpm
$ rpm -i ann-libs-1.1.1-4.el6.x86_64.rpm 
$ yum update

现在可以了。

Answer 2

在某些 RHEL 6 系统上遇到了同样的问题，结果发现问题在于 Graphviz 插件对某些 X11 库的隐藏依赖项，我可以通过安装以下 rpm 来安装它们：

• libXau
• libxcb
• libXext

所以，这解决了我的问题：yum install gtk2 libXau libxcb libXext