Biojava 示例运行时出现 ExceptionInInitializerError答案

【问题标题】：Biojava sample run with ExceptionInInitializerErrorBiojava 示例运行时出现 ExceptionInInitializerError
【发布时间】：2016-02-01 02:26:13
【问题描述】：

我尝试从维基百科运行一个非常简单的示例BioJava copy&pase。

package test;    
import org.biojava.nbio.data.sequence.FastaSequence;
import org.biojava.nbio.ronn.Jronn;

    public class Run {

    public static void main(String[] args) {

        FastaSequence fsequence = new FastaSequence("Prot1", "LLRGRHLMNGTMIMRPWNFLNDHHFPKFFPHLIEQQAIWLADWWRKKHC" +
                "RPLPTRAPTMDQWDHFALIQKHWTANLWFLTFPFNDKWGWIWFLKDWTPGSADQAQRACTWFFCHGHDTN" +
                "CQIIFEGRNAPERADPMWTGGLNKHIIARGHFFQSNKFHFLERKFCEMAEIERPNFTCRTLDCQKFPWDDP");
        Jronn.Range[] ranges = Jronn.getDisorder(fsequence);
    }
}

但是，当我运行它时，我得到以下异常：

   Exception in thread "main" java.lang.ExceptionInInitializerError
    at test.Run.main(Run.java:16)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:62)
    at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
    at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:497)
    at com.intellij.rt.execution.application.AppMain.main(AppMain.java:140)
Caused by: java.util.InputMismatchException
    at java.util.Scanner.throwFor(Scanner.java:864)
    at java.util.Scanner.next(Scanner.java:1485)
    at java.util.Scanner.nextFloat(Scanner.java:2345)
    at org.biojava.nbio.ronn.ModelLoader.loadModels(ModelLoader.java:188)
    at org.biojava.nbio.ronn.Jronn.<clinit>(Jronn.java:55)
    ... 6 more

Process finished with exit code 1

版本：

"biojava-protein-disorder"  4.1.0

【问题讨论】：

我建议将其发布到 biojava 邮件列表。这可能是他们的包装解析器中的一个错误。我对 RONN 一无所知，但 biojava 代码可能错误地解析了输出 RONN 文件。

标签： java jvm bioinformatics biojava

【解决方案1】：

这看起来像是在 4.2 中解决的 java 8 问题。可以试试最新版本的 biojava (4.2.1) 吗？

【讨论】：