在命令行上使用参数运行 RMarkdown

Question

我正在尝试从命令行终端运行 Rmarkdown 文件 (myfile.Rmd)。这个文件需要一个参数才能工作。我们可以以这个简单的文件为例：

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title: "Simple example"
output:
  pdf_document: default
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```{r read_arg, include=FALSE}
args = commandArgs(TRUE)
VAR = args[1]
```

```{r show_var}
VAR
```

那么，首先，是否可以像 Rscripts 那样通过读取参数来运行 Rmarkdown 文件？我的意思是，不是通过阅读this 问题中描述的输入文件。

如果是这样，怎么做？我希望用于运行 Rmarkdown 文件的工作 here 对我有用，但这不是因为争论。我正在尝试运行类似：

Rscript -e "rmarkdown::render('myfile.Rmd myarg')"

编辑：但它给出了以下错误：

工具错误::file_path_as_absolute(input) : 文件“myfile.Rmd_myarg”不存在 调用： -> setwd -> 目录名 -> Además：警告信息： 1：在 normalizePath(path, winslash = winslash, mustWork = mustWork) 中： path[1]="myfile.Rmd myarg": 不存在 el fichero o el Directorio 2：在 normalizePath(path, winslash = winslash, mustWork = mustWork) 中： path[1]="myfile.Rmd_myarg": 不存在 el fichero o el Directorio Ejecución interrumpida

有什么想法吗？谢谢！

Answer 1

添加myarg 对象作为参数是可行的方法：

Rscript -e "rmarkdown::render('example.Rmd',params=list(args = myarg))"

然后将参数添加到您的Rmd 文件中：

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title: "Simple example"
output:
  pdf_document: default
params:
  args: myarg
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此处的参数化报告文档：https://rmarkdown.rstudio.com/developer_parameterized_reports.html