无法在 docker 容器的 crontab 中运行 R 脚本

Question

我正在尝试在 docker 容器中运行 R 脚本。这是一个例子。

我的工作目录如下所示。

myRDocker
  -dockerfile
  -scripts
     -save_iris.R

在目录myRDocker中，有一个dockerfile和一个目录scripts，其中包含一个R脚本save_iris.R

我的 R 脚本 save_iris.R 如下所示：

write.csv(iris, '/data/iris.csv')

我的 dockerfile 如下：

# Install R version 3.6
FROM r-base:3.6.0

#install crontab
RUN apt-get update && apt-get -y install cron

RUN mkdir /data
COPY /scripts  /scripts

我去了我的目录myRDocker 并构建了 docker 镜像

docker build -t baser .

我在 bash 中运行 docker 容器。

docker run -it baser bash

进入容器后，我做到了：

crontab -e

然后添加这一行，然后保存

* * * * * Rscript /scripts/save_iris.R

它应该每分钟将文件保存到文件夹/data。但是，我从未在容器内的数据文件夹中找到任何文件。

我的问题是：

1. 我在上述过程中做错了什么？我觉得我可能遗漏了一些东西......但不知道为什么......

2. 如果我想在容器启动时运行计划的 cron 任务，我应该怎么做。 （类似于将 cron 任务放在一个文件中，并在容器启动时运行......）

Answer 1

为什么您不在容器运行时启动 cronjob，而不是在容器启动后运行？另外，我认为 crontab 进程不会在您的情况下运行，因为您的容器没有做任何事情。

试试这个，它将在容器运行时启动cron，并且还会跟踪 cron 作业的日志。但请记住，在这种情况下，您的主要进程是 tail -f /var/log/cron.log 而不是 cron 进程。

 FROM r-base:3.6.0

 RUN apt-get update &&  apt-get -y install cron

 RUN touch /var/log/cron.log
 COPY hello.r /hello.r
 RUN (crontab -l ; echo "* * * * * Rscript /hello.r  >> /var/log/cron.log") | crontab

# Run the command on container startup
 CMD cron && tail -f /var/log/cron.log

所以你会得到 Rscript 控制台日志到容器标准输出。

你好.r

print("Hello World from R")