r 遍历文件夹并搜索文件然后连接数据答案

【问题标题】：r looping through folders and searching for file and then concatenate datar 遍历文件夹并搜索文件然后连接数据
【发布时间】：2017-09-16 08:49:30
【问题描述】：

我有一个基本文件夹，里面有很多文件夹。我想去每个文件夹，找到一个名为 table_amzn.csv 的文件（如果存在），然后在 R 中读取所有这些文件，并将所有文件一个接一个地放在一个数据框中。我已经验证所有文件都有相同的列。我知道如何将 CSV 读入 R。但是我如何遍历基本文件夹中的所有文件夹并连接数据

【问题讨论】：

使用list.files()获取具有指定模式的文件名列表；使用read.csv 应用列表以将所有数据框读入单个列表；使用do.call("rbind", list) rbind 数据
list.files(pattern = "table_amzn.csv", recursive = TRUE, full.names = TRUE) 应该爬上所有文件夹并搜索特定文件名。结果应该是文件的完整路径。

标签： r csv find concatenation

【解决方案1】：

这在基础 R 中也很简单：

## change `dir` to whatever your 'base folder' actually is
dir <- '~/base_folder'
ff <- list.files(dir, pattern = "table_amzn.csv", recursive = TRUE, full.names = TRUE)

out <- do.call(rbind, lapply(ff, read.csv))

如果您的列相同但出于某种原因（错字等）具有不同的列名，您可以修改上述内容，如下所示：

out <- do.call(rbind, lapply(ff, read.csv, header = FALSE, skip = 1))
names(out) <- c('stub1', 'stub2') # whatever they should be

【讨论】：

【解决方案2】：

这是最近添加到包rio中的一个实现：

files <- list.files(pattern = "table_amzn.csv", recursive = TRUE, full.names = TRUE)

devtools::install_github("leeper/rio")
library(rio)
df <- import_list(files, rbind = TRUE)

这会将files 中的所有对象加载到单个data.frame 对象中。或者，如果您使用rbind = FALSE 调用，则会返回一个 data.frames 列表

【讨论】：