安装内核实验室包 R 失败。答案

【问题标题】：Failure to install kernlab package R.安装内核实验室包 R 失败。
【发布时间】：2013-11-20 00:13:35
【问题描述】：

我知道其他人也问过这个问题......但没有人真正提供解决方案。

我正在尝试安装 Kernlab R 包，我得到了这个：

.....

install.packages("kernlab")
Installing package into ‘C:/Users/Owner/Documents/R/win-library/3.0’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'http://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/3.0/kernlab_0.9-19.zip'
Content type 'application/zip' length 2029405 bytes (1.9 Mb)
opened URL
downloaded 1.9 Mb

Warning in install.packages :
  downloaded length 1978368 != reported length 2029405
Warning in install.packages :
  error 1 in extracting from zip file
Warning in install.packages :
  cannot open compressed file 'kernlab/DESCRIPTION', probable reason 'No such file or directory'
Error in install.packages : cannot open the connection

........

我尝试下载 zip 文件并从计算机打开它，但它显示 CRAN 存储库中的文件已损坏。我试过winrar，解压文件夹等。

我必须在数据分析 Coursera 课程中使用它并在那里发布问题。还没有人回答。

有谁知道可能是什么问题？

提前致谢，费利佩

【问题讨论】：

您是否尝试过使用不同的 CRAN 镜像？
或来源：install.packages("kernlab", type="source")
我尝试使用不同的镜像，但仍然无法正常工作...我还尝试了 psych 包和其他一些包，它告诉我文件已损坏
你试过重启R吗？
我认为我们需要会话信息。使用sessionInfo() 并将结果发布回您的原始问题。您的 R 版本可能已损坏。您可能需要尝试删除 R 并重新安装。

标签： r package failed-installation

【解决方案1】：

要安装 kernlab 软件包：Download 适用于您操作系统的 kernlab 二进制文件。然后打开终端并输入：

$R CMD INSTALL kernlab_0.9-19.tar

然后转到R并通过发出命令直接使用它：

library(kernlab)

【讨论】：

【解决方案2】：

我从 https://cran.r-project.org/web/packages/kernlab/index.html 并在以下位置解压：文档文件夹\R\win-library\3.2\kernlab 准备好了。

【讨论】：

这里非常不鼓励仅链接的答案，因为这些链接将来可能会失效。我建议您使用您引用的来源中的引用来编辑您的答案。

【解决方案3】：

我遇到了同样的问题，尝试在 R 控制台而不是 R Studio 上安装该软件包，然后在 R Studio 中使用该软件包。现在确定它为什么或如何工作，但它对我有用。

【讨论】：

【解决方案4】：

在 EC2 上遇到过这个问题

我做了几个链接后安装。

ln -s /usr/lib64/R/modules/lapack.so /usr/lib64/R/lib/libRlapack.so

ln -s /usr/lib64/libblas.so /usr/lib64/R/lib/libRblas.so

ln -s /usr/lib64/libgfortran.so.3.0.0 /usr/lib64/R/lib/libgfortran.so

ln -s /usr/lib64/libquadmath.so.0.0.0 /usr/lib64/R/lib/libquadmath.so

【讨论】：

【解决方案5】：

我刚刚尝试在 RStudio 中安装；它工作正常：

install.packages("kernlab")

这是我的 RStudio 版本：

Version 0.99.489 – © 2009-2015 RStudio, Inc.
Mozilla/5.0 (Macintosh; Intel Mac OS X 10_11_5) AppleWebKit/601.6.17 (KHTML, like Gecko)

【讨论】：

【解决方案6】：

我过去也遇到过类似的问题。当未为 R 设置“登录”信息时，可能会发生此错误，在这种情况下，您可能没有正确的权限 /tmp/ 您的 Sys.info() 响应是什么样的？如果您以“未知”身份登录，您可能会收到所说的权限错误。示例：

                                   sysname 
                                   "Linux" 
                                   release 
                                 <release>
                                   version 
                             <version info>
                                  nodename 
                                    <nodename> 
                                   machine 
                                  "x86_64" 
                                     login 
                                   "unknown"
                                      user 
                                   <your name> 
                            effective_user 
                                   <your name>

您可以通过确保向 R 传递正确的用户/uid 来设置登录。您通常可以在 .conf 文件中为 Rstudio、Rserve 等工具设置此信息。

【讨论】：

【解决方案7】：

实际上我最终修复了这个问题...当时我的笔记本电脑中存在一种非常奇怪的病毒，它不允许我安装任何东西，甚至是软件包。

这是一台非常旧的笔记本电脑，但我基本上从 PC 中删除了病毒，并且可以正常工作。

【讨论】：