使用 sqldf 进行模糊连接答案

【问题标题】：fuzzy join with sqldf使用 sqldf 进行模糊连接
【发布时间】：2018-07-25 05:03:45
【问题描述】：

我希望此代码在第 1 行返回 data.frame 和 name = helicase。如何与 sqldf 进行此类比较？

require(data.table)
df <- fread('EC              name
    2.1.1.233       helicase
    4.1.3.3         phosphatase
    1.3.2.1,2.5.4.1 lipase
')
df2 <- fread('     PDB     EC         
    1uay    2.1.1
    5ad4    4.1.3.3   
')


require(sqldf)

sqldf('
select  df2.*
        , df.name
from    df2
        left join df
          on df2.EC like df.EC
')

#    PDB      EC        name
# 1 1uay   2.1.1        <NA>
# 2 5ad4 4.1.3.3 phosphatase

【问题讨论】：

在您的情况下，默认 drv 是什么，因为我收到代码错误 Error in rsqlite_send_query(conn@ptr, statement) : no such column: df2.EC
@akrun 我如何找到它？
好的，我认为该示例正在创建 V1、V2 作为 df2 的列，因为有一些空白

标签： r sqldf fuzzy-comparison

【解决方案1】：

借用类似的答案here，您想要连接百分号：

sqldf("
select  df2.*
        , df.name
from    df2
        left join df
          on like('%'||df2.EC||'%', '%'||df.EC||'%')")

【讨论】：