R 包警告：“vignettes”目录中的文件比“inst/doc”中的所有文件都新答案

【问题标题】：R package warning: Files in the 'vignettes' directory newer than all files in 'inst/doc'R 包警告：“vignettes”目录中的文件比“inst/doc”中的所有文件都新
【发布时间】：2017-03-02 13:28:39
【问题描述】：

在 R 包中，我有两个旧版 Sweave 小插图作为 .Rnw 文件。当我在本地检查包时（在 R Studio 中：Build -> Check），没有错误或警告，当我使用 R 版本 3.3.1 Patched (2016-10) 在 R-Forge 上检查我的包时，情况也是如此-17 r71531)。

但是，当我将包提交给 Win-builder（通过 devtools::build_win()）在 R devel（不稳定）（2016-10-16 r71524）下检查时，我收到以下无法解决的警告：

Files in the 'vignettes' directory newer than all files in 'inst/doc':
  'fig/plot-Ortho-fm1.pdf', 'fig/plot-Ortho-fm3.pdf',
    'fig/plot-grades-can-class.pdf', 'fig/plot-grades-can-gpa.pdf',
    'fig/plot-grades-can-sex.pdf', 'fig/plot-grades-pairs.pdf',
    'fig/plot-hern-can-age.pdf', 'fig/plot-hern-can-build.pdf',
    'fig/plot-hern-can-cardiac.pdf', 'fig/plot-hern-can-pstat.pdf',
    'fig/plot-hern-pairs.pdf', 'fig/plot-jury-can1.pdf',
    ...

我的包目录结构包括vignettes/中的小插曲和inst/doc/中devtools::build_vignettes()的结果，如下：

...
man/
inst/
   doc/HE-examples.{pdf,R,Rnw}
   doc/repeated.{pdf,R,Rnw}
R/
vignettes/HE-examples.Rnw
         /repeated.Rnw
         /fig/   # all generated fig files

我将生成的.pdf 文件包含在inst/doc/ 中的原因是，否则我会收到警告说.pdf 文件需要使用qpdf 压缩，而我实际上可以做到这一点的唯一方法是在 Acrobat Pro 中打开它们并重新保存为压缩的 PDF。

我尝试将inst/doc 添加到.Rbuildignore，但这会产生错误。我也尝试将inst/doc/*.pdf 添加到.Rbuildignore，但这没有任何效果。

警告阻止我向 CRAN 提交更新。我不明白为什么vignettes/ 中的较新文件应该是一个问题，但我该如何解决警告？

【问题讨论】：

只是一个命令：你可以使用命令tools::compactPDF() 来减少你的小插图。
我试过这个，但由于某种原因，它对 PDF 文件没有影响，即使我安装了 qpdf 和 gs。
vignettes/ 中的较新文件是一个问题，因为inst/doc 中的文件可能来自一些以前版本的小插图。您可能对小插图做了一些工作，但不会向用户显示。

标签： r pdf sweave vignette

【解决方案1】：

如果其他人遇到此问题，我将发布答案。

devtools issue #1348 中提到了这个问题。解决方案只是删除inst/doc 下的所有小插图文件。就我而言，一个小插图 PDF 文件需要手动压缩以避免对qpdf 的投诉。

删除inst/doc/下的所有文件后，我重新复制了压缩后的PDF文件，所以现在比vignettes/下的文件更新

两个问题都解决了，CRAN 守护进程很高兴。

【讨论】：