【发布时间】:2017-07-06 08:20:40
【问题描述】:
我在处理一个既可以将回归摘要输出到 csv 文件又可以处理回归分析的函数时遇到问题。所以代码看起来像这样:
我有三个预测变量: age1(连续),gender1(分类 0/1),FLUSHOT(分类 0/1)
在文件中,前 100 列是我要测试的响应变量(所有分类 0/1)。
目标是对每个响应变量 (1:100) 进行回归分析,只输出 p 值、OR 和 CI。
所以我的代码是这样的:
fun1<-function(x){
res<-c(paste(as.character(summary(x)$call),collapse = " "),
summary(x)$coefficients[4,4],
exp(coef(x))[4],
exp(confint(x))[4,1:2],"\n")
names(res)<-c("call","p-value","OR","LCI","UCI","")
return(res)}
res2=NULL
lms=list()
for(i in 1:100)
{
lms[[i]]=glm(A[,i]~age1+gender1+as.factor(FLUSHOT),family="binomial",data=A)
res2<-rbind(res2,fun1(lms[[i]]))
}
write.csv(res2,"A_attempt1.csv",row.names=F)
例如,如果我们在每个类别中都有足够的样本量,或者边际频率如下所示:
table(variable1,FLUESHOT)
0 1
0 15 3
1 11 19
这段代码运行良好,但如果我们有类似的东西:
table(variable15,FLUESHOT)
0 1
0 15 0
1 11 19
代码遇到错误,报告并停止。
我尝试了多种使用 try() 和 tryCatch() 的方法,但似乎对我不起作用。
【问题讨论】:
标签: r function loops error-handling