【问题标题】:r rvest error: "Error in doc_namespaces(doc) : external pointer is not valid"r rvest 错误:“doc_namespaces(doc) 中的错误:外部指针无效”
【发布时间】:2019-10-09 05:35:07
【问题描述】:

我的问题类似于this one,但后者没有收到我可以使用的答案。我正在使用xml2::read_html 抓取数千个网址。这工作正常。但是当我尝试使用 purrr::map_df 和 html_nodes 解析生成的 html 文档时,出现以下错误:

Error in doc_namespaces(doc) : external pointer is not valid

由于某种原因,我无法使用示例重现该错误。下面的例子不好,因为它工作得很好。但是,如果有人可以从概念上向我解释错误的含义以及如何解决它,那就太好了(这里有一个类似问题的github thread,但我不遵循所有技术细节)。

library(rvest)
library(purrr)
urls_test <- list("https://en.wikipedia.org/wiki/FC_Barcelona",
             "https://en.wikipedia.org/wiki/Rome")
h <- urls_test %>% map(~{
  Sys.sleep(sample(seq(1, 3, by=0.001), 1))
  read_html(.x)})
out <- h %>% map_df(~{
  a <- html_nodes(., "#firstHeading") %>% html_text()
  a <- if (length(a) == 0) NA else a
  b <- html_nodes(., ".toctext") %>% html_text()
  b <- if (length(b) == 0) NA else b

  df <- tibble(a, b)
})

会话信息:

> sessionInfo()
R version 3.6.0 (2019-04-26)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Devuan GNU/Linux ascii

【问题讨论】:

标签: r error-handling rvest purrr xml2


【解决方案1】:

问题是,R 使用外部指针将 xml 存储在内存中。这些外部指针不存储在.rds 文件中。因此,一旦您保存项目并重新打开它,您将收到错误 external pointer is not valid。

解决方法: 使用 xml2::write_html() 将解析后的 html 保存到 html 文件中。如果您想稍后使用它,只需阅读它xml2::read_html()

另请参阅here 和并行处理here 和Parallel processing XML nodes with R 的更多信息

【讨论】:

    猜你喜欢
    • 1970-01-01
    • 2012-06-06
    • 2017-09-16
    • 2016-08-08
    • 2014-05-14
    • 1970-01-01
    • 2021-09-06
    • 1970-01-01
    • 2013-12-05
    相关资源
    最近更新 更多