在bash终端中将python函数与for循环结合起来答案

【问题标题】：combine python function with for loops in bash terminal在bash终端中将python函数与for循环结合起来
【发布时间】：2015-08-12 09:58:48
【问题描述】：

我的目标是打开多个文件（一个接一个，在 bash 终端中使用 for 循环）并使用 PLINK（一个程序）以及后来的 python 函数对其进行修改。以下是代码：

for i in {1..10}; do
  plink --cow --noweb --lfile $i --extract extract1.snp --recode --out 1$i
  python -c 'import file_convert;file_convert.convert_tree_mix("1$i.map","tmp$i")'
done

但是，正如预期的那样，python 无法读取并且无法打开“11.map”，它没有将“$i”替换为 1。我如何修改代码以便 python 函数结合 for 循环，每次根据“i”的值打开不同的文件

【问题讨论】：

试试python -c "import file_convert;file_convert.convert_tree_mix(\"1$i.map\",\"tmp$i\")"
非常感谢，成功了:)

标签： python bash for-loop

【解决方案1】：

你有没有试过这样调用python：

python -c 'import sys; import file_convert;file_convert.convert_tree_mix(sys.argv[1],sys.argv[2])' "1$i.map" "tmp$i";

【讨论】：

一般来说，这比尝试使用shell插值构建动态字符串让Python执行要好。

【解决方案2】：

您需要将整个 python 代码包含在双引号中，以便 python 代码中的$1 会扩展。 shell中的$1指的是第一个参数。

python -c "import file_convert;file_convert.convert_tree_mix(\"1$i.map\",\"tmp$i\")"

【讨论】：