删除多个子目录中的部分文件名

Question

主文件夹“Main”包含多个子文件夹（6900,159, 9997, ...），每个子文件夹包含 8 个项目（4 个文件（6900Log.final.out、6900Log.out、6900Log.progress.out、6900SJ .out.tab）、3 个文件夹（6900_STARgenome、6900_STARpass1、6900_STARtmp）和一个压缩文件（6900Aligned.sortedByCoord.out.bam））。 6900_STARtmp 包含更多子文件夹，但我不想更改 6900_STARtmp 中存在的子文件夹的名称。请看图

我想从 (6900Aligned.sortedByCoord.out.bam, 6900Log.final.out, 6900Log.out, 6900Log.progress.out, 6900SJ.out.tab) 中删除 6900 和从 (6900_STARgenome, 6900_STARpass1, 6900_STARtmp) 中删除 6900_

所以文件的名称应该是（Aligned.sortedByCoord.out.bam、Log.final.out、Log.out、Log.progress.out、SJ.out.tab、STARgenome、STARpass1、STARtmp）。

我尝试在 ubntu (18.04.3 LTS) 上运行以下脚本来重命名 SJ.out.tab 并计划对其余文件执行此操作，但它对我不起作用：

for filename in Main/*/*SJ.out.tab; do 
    #echo $filename
    describer=$(echo ${filename})        
    #mv "$filename" "${filename//${describer}/SJ.out.tab}"
done

我们将不胜感激。

Answer 1

为确保您不会意外修改其他文件或目录，您应确保脚本将自身限制为仅文件与目录名称相同的数字或以数字开头的目录和一个下划线，并且只有一层深。

试试这个：

#!/bin/bash

declare    base_dir=/path/to/Main

cd ${base_dir}
while read subdir; do
  number=${subdir#./}
  for file in $(find ${subdir} -maxdepth 1 -type f -name "${number}*"); do
    mv ${file} ${subdir}/${file##./${number}/${number}}
  done
  for file in $(find ${subdir} -maxdepth 1 -type d -name "${number}_*"); do
    mv ${file} ${subdir}/${file##./${number}/${number}_}
  done
done < <(find . -maxdepth 1 -type d -regex './[0-9]*')