Jupyter Notebook 的 virtualenvwrapper 安装使用 virtualenv python 但全局 pip 和包

Question

我有一个 virtualenvwrapper 包装的 virtualenv。我们称之为测试。 Jupyter 是通过我的全局 pip 和 virtualenv 的 pip 安装的。

$ which python
/usr/bin/python
$ which pip
/usr/local/bin/pip
$ which jupyter
/usr/local/bin/jupyter
$ workon test
(test)$ which python
/home/keon/.virtualenvs/test/bin/python
(test)$ which pip
/home/keon/.virtualenvs/test/bin/pip
(test)$ which jupyter
/home/keon/.virtualenvs/test/bin/jupyter

现在，我通过 /usr/local/bin/pip 安装了包 A，通过 /home/keon/.virtualenvs/test/bin/pip 安装了包 B。 （astropy 和 emcee resp.，但我不认为这很重要）

我启动 jupyter notebook（在测试 virtualenv 的 shell 中）。然后我在一个单元格中运行此代码：

import astropy
import emcee

： 并得到以下错误

---------------------------------------------------------------------------
ImportError                               Traceback (most recent call last)
<ipython-input-12-43214a4612e2> in <module>()
      1 import astropy
----> 2 import emcee

ImportError: No module named 'emcee'

在单元格中，我使用 !外壳命令：

!which python
!which pip
!which jupyter
!echo "Pip freeze below:\n---------------------"
!pip freeze

输出是

/home/keon/.virtualenvs/ph20/bin/python
/usr/local/bin/pip
/usr/local/bin/jupyter
Pip freeze below:
---------------------
[snip]
astropy==3.0.3

所以我的 python 是 virtualenv 的，但它似乎正在使用全局 jupyter 和 pip。

这个问题似乎只存在于我的一个虚拟环境中。如果我使用不同的，运行前面描述的相同单元格，输出符合预期：

/home/keon/.virtualenvs/test2/bin/python
/home/keon/.virtualenvs/test2/bin/pip
/home/keon/.virtualenvs/test2/bin/jupyter

Answer 1

当有多个 Jupyter Notebook 安装（全局和在特定的 virtualenv 中）时，这是一个常见问题。就我的经验而言，如果虚拟环境中没有安装 Jupyter，即使您在激活特定虚拟环境时发出命令，终端也会启动 Jupyter Notebook 的全局安装。因此，请确保 Jupyter 已安装在“测试”环境中，并在“测试”环境激活时发出“jupyter notebook”命令。

如果上述解决方案不起作用，并且您确定 virtualenv 的 Jupyter 实例正在运行，但它仍然无法检测到也安装在同一 virtualenv 中的特定包，您可以尝试从以下位置安装所需的包使用此处建议的方法在代码中： Installing python module within code

如果这两个都失败，我建议您创建一个新的 virtualenv，在其中安装 jupyter，在其中安装您需要的其他软件包，然后在 virtualenv 处于活动状态时尝试再次运行 jupyter 实例。

如果您不习惯使用 virtualenv 包装器管理多个虚拟环境，并且经常遇到此类错误，尤其是使用 jupyter，我建议您使用 Anaconda 并使用 GUI 创建虚拟环境，这样可以提供更简洁的管理系统并确保您的 Jupyter 实例使用正确的 virtualenv。