Pandas read_html 仅查找 html 表的标题

Question

我有这张桌子：

我使用 pandas 解析它：

s = '<table id="datatable"><tr><th onclick="sortTable(0)">Gene locus</th><th onclick="sortTable(1)">Organism</th><th onclick="sortTable(2)">Found in</th><th onclick="sortTable(3)">Gene name</th><th onclick="sortTable(4)">AA mutation</th><th onclick="sortTable(5)">Drug</th><th onclick="sortTable(6)">Tandem repeat name</th><th onclick="sortTable(7)">Tandem repeat sequence</th><th onclick="sortTable(8)">Reference</th></tr><td>ASPNIDRAFT_55947</td><td>Aspergillus niger</td><td>Animal - Human</td><td>CYP51a</td><td>R228Q </td><td>Posaconazole</td><td></td><td><div style="word-wrap: break-word;max-width: 250px;"></div></td><td><a href="http://jcm.asm.org/content/54/9/2365.full">10.1128/JCM.01075-16</a></td></tr></table>'
table = pandas.read_html(s)[0]
print(table)

但是这给了我：

Empty DataFrame
Columns: [Gene locus, Organism, Found in, Gene name, AA mutation, Drug, Tandem repeat name, Tandem repeat sequence, Reference]
Index: []

在标题 (<th>..) 下方显然有一个实心行 (<tr>...)，所以我不知道哪里出了问题，更重要的是我无法正确阅读表格。

（P.s. 我现在无法从我所在的国家/地区访问 Imgur，所以如果链接不合适，请随时更改它或告诉我如何更改它）

Answer 1

固定：

s = '<table id="datatable"><tr><th onclick="sortTable(0)">Gene locus</th><th onclick="sortTable(1)">Organism</th><th onclick="sortTable(2)">Found in</th><th onclick="sortTable(3)">Gene name</th><th onclick="sortTable(4)">AA mutation</th><th onclick="sortTable(5)">Drug</th><th onclick="sortTable(6)">Tandem repeat name</th><th onclick="sortTable(7)">Tandem repeat sequence</th><th onclick="sortTable(8)">Reference</th></tr><tr><td>ASPNIDRAFT_55947</td><td>Aspergillus niger</td><td>Animal - Human</td><td>CYP51a</td><td>R228Q </td><td>Posaconazole</td><td></td><td><div style="word-wrap: break-word;max-width: 250px;"></div></td><td><a href="http://jcm.asm.org/content/54/9/2365.full">10.1128/JCM.01075-16</a></td></tr></table>'
table = pandas.read_html(s)[0]
print(table)

您在第一个 </tr> 标记之后缺少一个 <tr> 标记。

输出：

         Gene locus  ...             Reference
0  ASPNIDRAFT_55947  ...  10.1128/JCM.01075-16

[1 rows x 9 columns]

Answer 2

您在第一个 <td> 之前缺少一个 <tr>

这是正确的字符串，

s = '<table id="datatable"><tr><th onclick="sortTable(0)">Gene locus</th><th onclick="sortTable(1)">Organism</th><th onclick="sortTable(2)">Found in</th><th onclick="sortTable(3)">Gene name</th><th onclick="sortTable(4)">AA mutation</th><th onclick="sortTable(5)">Drug</th><th onclick="sortTable(6)">Tandem repeat name</th><th onclick="sortTable(7)">Tandem repeat sequence</th><th onclick="sortTable(8)">Reference</th></tr><tr><td>ASPNIDRAFT_55947</td><td>Aspergillus niger</td><td>Animal - Human</td><td>CYP51a</td><td>R228Q </td><td>Posaconazole</td><td></td><td><div style="word-wrap: break-word;max-width: 250px;"></div></td><td><a href="http://jcm.asm.org/content/54/9/2365.full">10.1128/JCM.01075-16</a></td></tr></table>'

现在可以了。