【发布时间】:2021-07-24 06:46:55
【问题描述】:
【问题讨论】:
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如果您可以提供一些代码来生成与实际数据具有相同坐标和维度的小型示例数据集,而不仅仅是屏幕截图,这将很有帮助。
标签: python python-xarray dimensions
【问题讨论】:
标签: python python-xarray dimensions
您可以使用stack 方法创建时间和步长维度的多索引。由于您的 valid_time 坐标已经具有正确的 datetimedimension,因此您还可以删除多索引坐标并仅将 valid_time 坐标与实际日期时间保持一致。
import numpy as np
import xarray as xr
import pandas as pd
# Create a dummy representation of your data
ds = xr.Dataset(
data_vars={"a": (("x", "y", "time", "step"), np.random.rand(5, 5, 3, 24))},
coords={
"time": pd.date_range(start="1999-12-31", periods=3, freq="d"),
"step": pd.timedelta_range(start="1h", freq="h", periods=24),
},
)
ds = ds.assign_coords(valid_time=ds.time + ds.step)
# Stack the time and step dims
stacked_ds = ds.stack(datetime=("time", "step"))
# Drop the multiindex if you want to keep only the valid_time coord which
# contains the combined date and time information.
# Rename vars and dims to your liking.
stacked_ds = (
stacked_ds.drop_vars("datetime")
.rename_dims({"datetime": "time"})
.rename_vars({"valid_time": "time"})
)
print(stacked_ds)
<xarray.Dataset>
Dimensions: (time: 72, x: 5, y: 5)
Coordinates:
* time (time) datetime64[ns] 1999-12-31T01:00:00 ... 2000-01-03
Dimensions without coordinates: x, y
Data variables:
a (x, y, time) float64 0.1961 0.3733 0.2227 ... 0.4929 0.7459 0.4106
这样,我们创建了一个以连续日期时间序列为坐标的单一时间维度。然而,它不是和index。对于某些方法,例如resample,时间需要是一个索引。我们可以通过显式设置索引来解决这个问题:
stacked_ds.set_index(time="time")
但是,这将使“时间”成为变量而不是坐标。为了让它再次成为一个坐标,我们可以使用
stacked_ds.set_index(time="time").set_coords("time")
您也可以在 Dataarrays 上使用维度堆叠。但是,它们没有 rename_dims 和 rename_vars 方法。相反,您可以使用swap_dims 和rename:
(
ds.a.stack(datetime=("time", "step"))
.drop_vars("datetime")
.swap_dims({"datetime": "time"})
.rename({"valid_time": "time"})
).set_index(time="time")
【讨论】:
time需要成为索引,但目前不是。我们可以通过使用stacked_ds.set_index(time="time") 显式设置索引来解决这个问题。然后重新采样应该起作用。出于某种原因,将时间设置为索引会使其成为变量而不是坐标,但我们可以通过使用 set_coords("time") 来解决这个问题。