如何通过手动限制设置协调 Matplotlib 散点图中的点注释？

Question

我正在尝试使用手动限制设置来协调 Matplotlib 散点图中的点注释，但我收到错误消息或遇到设计问题。

这是我的代码：

fig, ax = plt.subplots(figsize = (20,10)) #manual limit setting
plt.axis([-2,3,-2.5,5])
plt.scatter(x, y)


for i, txt in enumerate(n):   #dot annotation   
    ax.annotate(txt, (x[i], y[i]))

这是输出的屏幕截图（我得到了最终的散点图，它是一个位于白色大矩形左角的小矩形：

我也试过这个：

 fig, ax = plt.subplots(figsize = (20,10))
    ax = plt.axis([-2,3,-2.5,5])
    plt.scatter(x, y)


for i, txt in enumerate(n):
    ax.annotate(txt, (x[i], y[i]))

当然，我收到了以下错误消息（即使图表正确显示，但每个对应点旁边没有标签）。

AttributeError: 'list' object has no attribute 'annotate'

出现错误是因为我的循环尝试遍历 ax = plt.axis([-2,3,-2.5,5])，这确实没有意义。

有什么办法可以解决这个问题吗？

谢谢

Answer 1

出现此问题的原因是在剪辑时文本的特殊大小写。通常您可能希望显示轴外的文本。因此注释和文本有一个annotation_clip 参数。但是，这会在保存注释时干扰bbox_inches="tight" 选项，因为注释仍然被视为布局的一部分，因此该图仍将轴外的注释考虑在内。

两种解决方案：

1. 设置annotation_clip 和 clip_on。 IE。您可以明确地告诉注释在轴上剪辑：

   ax.annotate(txt, (x[i], y[i]), annotation_clip=True, clip_on=True)
   

2. 将bbox_inches 设置为None。使用 IPython 内联后端时，您可以告诉它不要通过

   %config InlineBackend.print_figure_kwargs = {'bbox_inches':None}
   

   在开始创建内容之前在一个单元格中。 （见this answer）

Answer 2

我无法复制第一个问题（在 2.2.3、3.1.1、3.1.2 版本中尝试过） - 我得到了 this（使用随机数据）。尝试升级您的 matplotlib 版本或使用

plt.savefig('/path/to/output/image.png')

将图形保存到磁盘而不是直接显示，看看问题是否仍然存在。

但是我可以解释错误

AttributeError: 'list' object has no attribute 'annotate'

这是因为plt.axis() 返回[xmin, xmax, ymin, ymax]，而不是axes 实例（fig, ax = plt.subplots(figsize=(20,10) 将axes 实例返回到ax）。