如何防止 Matplotlib 剪掉我的轴标签？答案

【问题标题】：How to prevent Matplotlib from clipping away my axis labels?如何防止 Matplotlib 剪掉我的轴标签？
【发布时间】：2014-05-13 13:57:41
【问题描述】：

我正在为一篇科学论文准备一些图，这些图需要宽而短才能符合页数限制。但是，当我将它们保存为 pdf 时，缺少 x 轴标签，因为（我认为）它们在边界框之外。

将以下内容放入 iPython 笔记本会重现该问题。

%pylab inline
pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)
plot([1,5,2,4,6,2,1])
xlabel("$x$")
ylabel("$y$")
savefig("test.pdf")

生成的 pdf 文件如下所示：

如何更改 pdf 文件的边界框？理想情况下，我想要一个“正确执行”的解决方案，即自动调整大小以使所有内容都整齐排列，包括消除左右两侧不必要的空间 - 但我很着急，所以我会满足于任何改变边界框的方法，如果必须的话，我会猜测数字直到它看起来正确。

【问题讨论】：

【解决方案1】：

在google了一下，找到了答案：你可以给savefig命令bbox_inches='tight'，它会自动调整边界框到内容的大小：

%pylab inline
pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)
plot([1,5,2,4,6,2,1])
xlabel("$x$")
ylabel("$y$")
savefig("test.pdf",bbox_inches='tight')

我猜那是一些紧的英寸。

请注意，这与 Ffisegydd 的答案略有不同，因为它将边界框调整为绘图，而不是更改绘图以适应边界框。（但两者都适合我的目的。）

【讨论】：

【解决方案2】：

您可以使用plt.tight_layout() 让 matplotlib 调整您的绘图布局。 tight_layout() 会自动调整尺寸，也可以在你有（例如）重叠标签/刻度/等时使用。

%pylab inline

pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)

plot([1,5,2,4,6,2,1])

xlabel("$x$")
ylabel("$y$")

tight_layout()

savefig("test.pdf")

这是输出的 .png（无法将 pdf 上传到 SO，但我已经检查过了，它的工作方式与 pdf 相同）。

【讨论】：

【解决方案3】：

如果您正在为科学论文准备情节，我建议您自己进行“剪辑”，使用

plt.subplots_adjust(left,right,bottom,top,..)

在创建图窗之后和保存之前。如果您从 ipython 控制台运行，您还可以在生成图形后调用 subplots_adjust，并通过反复试验调整边距。一些后端（我认为至少是 Qt 后端）也为此功能公开了一个 GUI。

手动执行此操作需要时间，但大多数时候可以提供更精确的结果，尤其是根据我的经验使用 Latex 渲染。

当您必须垂直或水平堆叠两个图形时，这是唯一的选择（例如，使用像 subfigure 这样的包），因为 tight_layout 不能保证两个图形中的边距相同，并且轴将导致在论文中未对齐。

这是一个很好的 link@ 使用 matplotlib 进行出版物，包括例如如何设置图形宽度以匹配期刊列宽。

【讨论】：