安装 Google Protocol Buffers R 包时出现问题答案

【问题标题】：Problems installing Google Protocol Buffers R Package安装 Google Protocol Buffers R 包时出现问题
【发布时间】：2013-06-05 10:22:09
【问题描述】：

有没有人知道为什么会发生这种情况？我以 root 身份运行 R。这是版本：

版本 _
平台 x86_64-redhat-linux-gnu
拱 x86_64
操作系统 linux-gnu
系统 x86_64, linux-gnu
状态
专业 3
次要 0.1
2013 年
05月
第 16 天
svn 版本 62743
语言 R
version.string R 版本 3.0.1 (2013-05-16) 昵称好运动

它似乎走得很远。无论我是从源代码还是从软件包安装软件包，我都会收到此错误：

> ** building package indices
** installing vignettes
   ‘RProtoBuf-intro.Rnw’ 
   ‘RProtoBuf-quickref.Rnw’ 
   ‘RProtoBuf-unitTests.Rnw’ 
** testing if installed package can be loaded
Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : 
  unable to load shared object '/usr/lib64/R/library/RProtoBuf/libs/RProtoBuf.so':
  /usr/lib64/R/library/RProtoBuf/libs/RProtoBuf.so: undefined symbol: _ZN6google8protobuf2io18CopyingInputStream4SkipEi
Error: loading failed
Execution halted
ERROR: loading failed
*  removing ‘/usr/lib64/R/library/RProtoBuf’

【问题讨论】：

标签： r protocol-buffers

【解决方案1】：

您安装了哪个版本的 Protocol Buffers 库？

在 Ubuntu 上，使用默认版本的 Google Protocol Buffers（当前：2.4.1），它“正常工作”。该软件包仅检查 2.2.0 的最低版本。

【讨论】：

我在 CentOS 版本 6.4 (Final) 上运行。我已经安装了 protobuf-2.4.1，但我才意识到它不在 /usr/lib64 中……而是在 /usr/local/lib 中。它虽然在 LD_LIBRARY_PATH 上。似乎它正在寻找它正在构建的同一个库？
您需要查看配置输出和实际的链接步骤（您没有显示）并尝试相应地修复。在配置运行期间，我们确实会询问 pkg-config --libs protobuf...
您是否尝试将其添加到 .bashrc export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib 然后重新启动 R Studio？默认情况下，protobuf lib 将安装到 /usr/local。
每一个非脑死系统在默认的ld.conf路径下都有/usr/local/lib，但可能sudo ldconfig需要运行刷新缓存...

【解决方案2】：

我有一个类似的问题，我按照配置 protobuf 库的说明解决了这个问题。

./configure --prefix=/usr

https://github.com/google/protobuf：在“安装位置提示”下。

【讨论】：