导入 Cython 模块时出现未定义符号错误答案

【问题标题】：Undefined symbol error importing Cython module导入 Cython 模块时出现未定义符号错误
【发布时间】：2012-10-13 03:41:15
【问题描述】：

我想将我的一个 c++ 类作为 Python 模块提供。该类在标头Foo.h 中声明，并在.cpp Foo.cpp 中实现。（g++-4.5，Ubuntu x86_64）。这是一个非常非常简单的类：

Foo.cpp:

Foo::Foo() : alfa(1.0), beta(1)
{

}

Foo::~Foo()
{
}

Foo.h:

 class Foo
 {
 public:

  Foo()
  Foo(const Foo& orig);
  ~Foo();
  double alfa;
  int beta; 
 };

我创建了一个setup.py，如 Cython 教程所示：

setup.py

from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Distutils import build_ext

setup(
  name = 'MyDemo',
  ext_modules=[
    Extension("Foo"
          sources=["Foo.pyx"], 
          include_dirs=[".","../eigen/"],
          language="c++"),
    ],
  cmdclass = {'build_ext': build_ext},
)

并按照 cython 教程的说明编写我的Foo.pyx cython 模块：

Foo.pyx

cdef extern from "Foo.h":
    ctypedef struct c_Foo "Foo":
        double alfa
    c_Foo *new_Foo "new Foo" ()
    void del_Foo "delete" (c_Foo *myfoo)

cdef class Foo:
    cdef c_Foo *thisptr      # hold a C++ instance which we're wrapping
    def __cinit__(self):
         self.thisptr = new_Foo()
    def __dealloc__(self):
         del_Foo(self.thisptr)

我使用以下命令编译它： python setup.py build_ext --inplace

running build_ext
skipping 'Foo.cpp' Cython extension (up-to-date)
building 'Foo extension
gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I. -I../eigen/ -I/usr/include/python2.6 -c Foo.cpp -o build/temp.linux-x86_64-2.6/Foo.o
cc1plus: warning: command line option "-Wstrict-prototypes" is valid for Ada/C/ObjC but not for C++
g++ -pthread -shared -Wl,-O1 -Wl,-Bsymbolic-functions build/temp.linux-x86_64-2.6/Foo.o -o /home/linello/prova/Foo.so

现在 Foo.so 共享库对象已创建，但当我想从 python 导入它时，我得到：

 >>> import Foo
      Traceback (most recent call last):
      File "<stdin>", line 1, in <module>
      ImportError: ./Foo.so: undefined symbol: _ZN4FooD1Ev
>>>

我认为 _ZN4FooD1Ev 是 Foo 的构造函数的错位名称，但不明白缺少符号的原因。

我真的不明白共享对象文件中缺少什么符号。第二点，在python setup.py build_ext --inplace 命令之后，我的Foo.cpp 文件搞砸了并且包含了cythonized 版本。

如何以其他格式重命名 cythonized 文件（例如 .cxx）并避免链接器错误？

然后我修改了pFoo.pyx 中的Foo.pyx 并因此修改了setup.py，现在在设置命令之后，我在Foo.cxx 中有pFoo.pyx 的cythonized 版本，但是当我尝试导入时，我得到了

ImportError: dynamic module does not define init function (initpyFoo)

我的设置有什么问题以及如何解决我的问题？

【问题讨论】：

Foo 类是否在 cpp 文件中定义了其复制构造函数？
不，它实际上没有定义复制构造函数，当在pyFoo.pyx中定义并重命名Foo.pyx的名称时我解决了问题。

标签： python cython distutils undefined-reference

【解决方案1】：

我建议您为 cython 模块使用不同的名称，例如cFoo，避免名称冲突问题：

from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize

setup(ext_modules = cythonize(
           "cFoo.pyx",                 # our Cython source
           sources=["Foo.cpp"],        # additional source file(s)
           language="c++",             # generate C++ code
      ))

要定义 C++ 类，请使用“cppclass”关键字，如下所示：

cdef extern from "Foo.h":
    cdef cppclass Foo:
        Foo()
        double alfa
        int beta

然后您应该能够像这样访问您的课程：

cdef Foo *foo = new Foo()
foo.beta = 42

【讨论】：