通讯指令问题

Question

我正在尝试比较两个基因列表并提取常见的。我对我的 .txt 文件进行了排序并使用了 comm 命令：

comm 基因_list1.txt 基因_list2.txt

奇怪的是，当我检查输出时，有很多常见的基因没有打印在第三行。以下是部分输出：

如您所见，AAAS 和 AAGAB 等都存在于两个文件中，但它们没有打印为公共行！知道为什么会这样吗？

谢谢

Answer 1

$ comm file1.txt file2.txt

上述命令的输出包含三列，其中第一列由零个制表符分隔，并且包含 仅 存在于 file1.txt 中的名称。

第二列包含 仅 存在于 file2.txt 中并由一个制表符分隔的名称。

第三列包含两个文件通用的名称，并由行首的两个制表符分隔。

这是不使用选项时 comm 命令产生的输出的默认模式。

我假设，两个输入文件都按排序顺序。那么您的用例所需的命令将是

$ comm -12 gene_list1.txt gene_list2.txt

这意味着两列（1 和 2）都被抑制（不显示）。因为您只对两个文件共有的元素感兴趣。