在 python 脚本中处理 perl 脚本答案

【问题标题】：Process a perl script within a python script在 python 脚本中处理 perl 脚本
【发布时间】：2015-09-11 16:18:48
【问题描述】：

我正在尝试在另一个 python 脚本中执行 perl 脚本。我的代码如下：

command = "/path/to/perl/script/" + "script.pl"
input = "< " + "/path/to/file1/" + sys.argv[1] + " >"
output = "/path/to/file2/" + sys.argv[1]

subprocess.Popen(["perl", command, "/path/to/file1/", input, output])

执行python脚本时，返回：

No info key.

所有指向 perl 脚本的路径和文件都是正确的。

我的 perl 脚本是用命令执行的：

perl script.pl /path/to/file1/ < input > output

对此的任何建议都非常感谢。

【问题讨论】：

尝试以下方法，如此 SO stackoverflow.com/questions/25079140/…
什么意思，什么都没发生？就输出而言，您 communicate 使用该进程，但您不会在 Python 脚本中打印或以其他方式对通信结果（进程的标准输出）执行任何操作。根据the documentation：“communicate() 返回一个元组（stdoutdata，stderrdata）。” （强调我的。）
您正在使用 shell 重定向运算符作为输入字符串的一部分。因此，子进程将尝试运行类似perl /path/to/perl/script/script.pl '< /path/to/file1/arg1 >' /path/to/file2/ 的东西。也就是说，< 和 > 成为输入文件名的一部分。
@Evert 非常感谢！我让它工作了。是的，它的 shell 重定向，我用标准输入和标准输出替换它，它现在应该正常工作。

标签： python perl subprocess

【解决方案1】：

shell命令的类比：

#!/usr/bin/env python
from subprocess import check_call

check_call("perl script.pl /path/to/file1/ < input > output", shell=True)

是：

#!/usr/bin/env python
from subprocess import check_call

with open('input', 'rb', 0) as input_file, \
     open('output', 'wb', 0) as output_file:
    check_call(["perl", "script.pl", "/path/to/file1/"],
               stdin=input_file, stdout=output_file)

为了避免冗长的代码，你可以use plumbum to emulate a shell pipeline:

#!/usr/bin/env python
from plumbum.cmd import perl $ pip install plumbum

((perl["script.pl", "/path/to/file1"] < "input") > "output")()

注意：只有带有shell=True 的代码示例运行shell。第 2 和第 3 个示例不使用 shell。

【讨论】：