在给定的 conda 环境中执行 python 脚本的最佳方法答案

【问题标题】：Best way to execute a python script in a given conda environment在给定的 conda 环境中执行 python 脚本的最佳方法
【发布时间】：2017-06-20 21:06:30
【问题描述】：

我想使用 subprocess 包从另一个 python 脚本 trigger.py 执行 python 脚本 executed.py。 executed.py 必须在与 trigger.py 不同的 conda 环境中运行（比如说 executed_env 和 trigger_env）。最好的方法是什么？我当前的trigger.py 代码是：

command = "python executed.py --option1 -dir /path/to/dir"
args = shlex.split(command)
my_subprocess = subprocess.Popen(args)

由于executed.py 在trigger_env 环境中运行，因此返回错误。

【问题讨论】：

标签： python subprocess environment conda

【解决方案1】：

如果您只需要使用其他 python，那么我相信您只需要在 command 中使用指向其他 python 的完整路径。

尝试进入您的executed_env（即，如果是Linux，则为source activate executed_env）并执行which python。让我们假设返回 HOME/.conda/envs/executed_env/bin/python 现在它变成了您在命令中使用的 python - 即 command = "HOME/.conda/envs/executed_env/bin/python executed.py --option1 -dir /path/to/dir"。这个

例如，让我们在不同的 python 版本中运行executed.py。

创建你的py27环境conda create -n py27 python=2.7这是trigger_env。
创建您的 py35 环境 conda create -n py35 python=3.5 这是 executed_env。
通过运行source activate py35 和which python 获取到py35 的完整python 路径（我们称它为EXECUTED_PYTHON 来进行描述）。通过source deactivate停用。
然后我们创建executed.py
```
import sys
print(sys.version)
```

然后是trigger.py（包括参数，但它们什么也没做）

command = "EXECUTED_PYTHON executed.py --option1 -dir /path/to/dir"
args = shlex.split(command)
my_subprocess = subprocess.Popen(args)

现在让我们在trigger_env -- source activate py27 和python trigger.py 中运行它。
这将打印3.5.2 |Continuum Analytics, Inc. [...]（3.5 是重要部分）。你可以看到它正在使用executed_env中的另一个python。

【讨论】：

我在写问题时想到了这一点。对于部署来说，它不是很舒服......

【解决方案2】：

我对任何 conda 内置方法进行了一些研究，并发现了以下内容。第一个是解决方法，第二个是最终解决方案内置解决方案（在撰写本文时不可用）。

conda 包装器。 Guilherme Melo 在 conda 环境中为 python 可执行文件创建了一个包装器。如果您在 IDE 中将其设置为 python 解释器，例如PyCharm，它将激活调用它的 conda 环境，然后调用 python 解释器。在“创建 conda 包装器”部分下查看此处： https://pypi.org/project/exec-wrappers/
conda 运行。在a standard and fast way to execute a command inside an environment 上的 conda github 页面上进行了长时间的讨论，导致了一个新命令的实现（实际上是一个重新调用，因为它以前可用）： conda run

它在issue #7320 中进行了描述，并有望在 2018 年 10 月在conda-4.6 中发布！

【讨论】：

只是补充一下，因为我一直在弄乱语法：conda run -n envname python -c "print('Hello!')"

【解决方案3】：

在 windows 环境中使用 conda，我只是复制了 conda 的方式，用于从不同的环境中启动不同的 jupyter notebook。所有快捷方式都使用“C:\ProgramData\Anaconda3\python.exe”调用“C:\ProgramData\Anaconda3\cwp.py”脚本，然后通过附加参数，您可以选择要执行的环境和文件。

在我的例子中，环境名称 = AutomateXXReporting，要执行的文件 = C:\Users\ismael.serrano\Documents\GIT\xxx\notebooks\exports\get_JIRA_user_streams.py

C:\ProgramData\Anaconda3\python.exe C:\ProgramData\Anaconda3\cwp.py C:\Users\ismael.serrano\.conda\envs\AutomateXXReporting C:\Users\ismael.serrano\.conda\envs\AutomateXXReporting\python.exe C:\Users\ismael.serrano\Documents\GIT\xxx\notebooks\exports\get_JIRA_user_streams.py

以前我按照保罗的指示成功地进行了，但遇到了一个不够充分的情况。完整路径中的 python 无法找到一些库，使用 cwp.py 它可以工作。

【讨论】：