散景：模型必须由单个文档拥有答案

【问题标题】：Bokeh: Models must be owned by only a single document散景：模型必须由单个文档拥有
【发布时间】：2017-02-05 17:42:09
【问题描述】：

我在 Jupyter 笔记本中使用 Bokeh 0.12.2，它经常抛出有关“模型必须仅由单个文档拥有”的异常：

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RuntimeError                              Traceback (most recent call last)
<ipython-input-23-f50ac7abda5e> in <module>()
      2     ea.legend.label_text_font_size = '10pt'
      3 
----> 4 show(column([co2, co, nox, o3]))

C:\Users\pokeeffe\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\io.py in show(obj, browser, new, notebook_handle)
    308     '''
    309     if obj not in _state.document.roots:
--> 310         _state.document.add_root(obj)
    311     return _show_with_state(obj, _state, browser, new, notebook_handle=notebook_handle)
    312 

C:\Users\pokeeffe\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\document.py in add_root(self, model)
    443             self._roots.append(model)
    444         finally:
--> 445             self._pop_all_models_freeze()
    446         self._trigger_on_change(RootAddedEvent(self, model))
    447 

C:\Users\pokeeffe\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\document.py in _pop_all_models_freeze(self)
    343         self._all_models_freeze_count -= 1
    344         if self._all_models_freeze_count == 0:
--> 345             self._recompute_all_models()
    346 
    347     def _invalidate_all_models(self):

C:\Users\pokeeffe\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\document.py in _recompute_all_models(self)
    367             d._detach_document()
    368         for a in to_attach:
--> 369             a._attach_document(self)
    370         self._all_models = recomputed
    371         self._all_models_by_name = recomputed_by_name

C:\Users\pokeeffe\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\model.py in _attach_document(self, doc)
     89         '''This should only be called by the Document implementation to set the document field'''
     90         if self._document is not None and self._document is not doc:
---> 91             raise RuntimeError("Models must be owned by only a single document, %r is already in a doc" % (self))
     92         doc.theme.apply_to_model(self)
     93         self._document = doc

RuntimeError: Models must be owned by only a single document, <bokeh.models.tickers.DaysTicker object at 0x00000000042540B8> is already in a doc

触发器总是调用show(...)（虽然从来没有在内核启动后第一次调用，只有后续调用）。

根据文档，我认为reset_output() 会使我的笔记本恢复到可操作状态，但异常仍然存在。通过反复试验，我确定有必要重新定义传递给show() 的所有内容。这使得交互式工作变得繁琐且容易出错。

[Ref]：

reset_output(state=None)

清除所有输出模式的默认状态。

返回：无

我对 reset_output() 的看法是否正确——它应该解决导致此异常的情况吗？
否则，我该如何避免这种异常？

【问题讨论】：

我的第一个建议是升级。 Bokeh 和 Notebook 都是非常大的、跨运行时的东西，集成它们是不断改进的挑战。我知道自0.12.2 以来一直有工作，尽管我没有时间研究细节。否则，请发布完整的代码示例以检查/试用。例如，我知道多次显示相同的图可以正常工作（我只是尝试确定），因此如果没有测试笔记本来重现问题，就无法推测您的具体问题是什么。

标签： bokeh

【解决方案1】：

column_data_source = ColumnDataSource(dataframe)

在 jupyter notebook 中使用列数据源的每一行之后，我们必须简单地重新创建它。列数据源好像不能在同一个代码中多次使用。

这似乎有点小技巧，但当我遇到同样的错误时它对我有用。

【讨论】：

【解决方案2】：

我一直在使用 jupyterlab notebook 迭代使用散景、全息视图和面板对大量数据进行可视化，并且定期遇到此问题。

这里还有一些可能会有所帮助的其他事项。请注意，p 用作该图的散景常规名称。我在这个旧线程上发帖是因为它是我在 Google 搜索错误消息时的最高结果。

尝试清除文档（位于docs）：

from bokeh.io import curdoc

curdoc().clear()

我观察到panel 能够显示散景对象，即使散景显示无法显示。

import panel as pn

pn.extension()

pn.pane.Bokeh(p)

深入研究即使没有散景，面板如何显示对象，我注意到function，它为我解决了这个问题：

import panel as pn

pn.io.model.remove_root(p)

如果您没有安装面板，这里是上面的来源code：

from bokeh.models import Model

for model in p.select({'type': Model}):
    prev_doc = model.document
    model._document = None
    if prev_doc:
        prev_doc.remove_root(model)

希望这对某人或未来的我有所帮助。

【讨论】：

【解决方案3】：

在创建每个情节后尝试使用。 add_root 会将该模型添加为当前文档的根目录，确保将每个模型添加到单个文档中：

    curdoc().add_root(column([plot]))
    curdoc().title = doc_title //Add a title to the doc
    show(figure)

注意：column(the list of plots) 可以替换为任何继承 Model 类的对象。

有关add_root 和散景文档的更多详细信息，请参阅链接：https://docs.bokeh.org/en/latest/docs/reference/document.html?highlight=add_root#bokeh.document.document.Document.add_root

【讨论】：

欢迎来到 StackOverFlow，您能否添加更多详细信息，说明您的答案如何达到问题要求以及与其他提议的问题相比如何？

【解决方案4】：

此解决方案无需升级或降级软件包即可工作。

try:
    reset_output()
    output_notebook()
    show(p)
except:
    output_notebook()
    show(p)

这里提供的解决方案：

https://github.com/bokeh/bokeh/issues/8579

【讨论】：

【解决方案5】：

似乎可以通过区分源名称来修复像这样：

source1 = df
p1.circle('A', 'B', source=source1)

source2 = df
p2 = figure()
p2.circle('C', 'D', source=source2)

sourceN = df
p2 = figure()
p2.circle('X', 'Y', source=sourceN)

【讨论】：

【解决方案6】：

在我升级到 bokeh 版本 1.01 后，我在使用来自 bokeh.embed 的 file_html 时遇到了此错误消息。再次降级到散景版本 0.12.16 解决了它。（点安装散景==0.12.16）请注意确定原因。

【讨论】：

从 1.0.1 到 0.13.0 为我修复了它。

【解决方案7】：

这可能是因为具有相同名称的对象冲突。您每次都需要创建全新的对象。

【讨论】：