基于两列合并两个文件

Question

我有一个与之前的帖子非常相似的问题： Merging two files by a single column in unix 但我想基于两列合并我的数据（顺序相同，所以不需要排序）。 例如，

subjectid subID2 姓名年龄
12 121 简 16
24 241 克里斯汀 90
15 151 克拉克 78
23 231 乔安 31

subjectid subID2 prob_disease
12 121 0.009
24 241 0.738
15 151 0.392
23 231 1.2E-5

输出看起来像

subjectid SubID2 prob_disease 名称年龄
12 121 0.009 简 16
24 241 0.738 克里斯汀 90
15 151 0.392 克拉克 78
23 231 1.2E-5 乔安娜 31

当我使用 join 时，它只考虑第一列（subjectid）并重复 SubID2 列。 请问有没有办法通过join或其他方式做到这一点？谢谢你

Answer 1

join 命令没有扫描多个字段作为连接条件的选项。因此，您将不得不在组合中添加一些智能。假设您的文件在每行上都有固定数量的字段，您可以使用以下内容：

join f1 f2 | awk '{print $1" "$2" "$3" "$4" "$6}'

只要字段计数如您的示例中所示。否则，需要在awk命令中调整打印的范围，增加或去掉一些字段。

Answer 2

如果顺序相同，您仍然可以按单列合并并指定要输出的列的格式，例如：

join -o '1.1 1.2 2.3 1.3 1.4' file_a file_b

如join(1) 中所述。