在python中合并两个没有公共列的文本文件答案

【问题标题】：merge two text file without common column in python在python中合并两个没有公共列的文本文件
【发布时间】：2015-02-27 00:12:04
【问题描述】：

我有 2 个行数相同的文本文件，但我的文件之间没有公共列。第一个文件有 9 列，第二个文件有 8 列。它们都有 111557 行。 2 个文件中的行顺序是相同的，所以我只想简单地合并它们，这意味着我将拥有一个包含 17 列的文本文件。

这是第一个 .txt 文件的第一列（它们受制表符限制）

     chr1   HAVANA  gene    29554   31109   .   +   .

这是第二个 .txt 文件的第一行（它们受制表符限制）

     ENSG00000243485.2  ENSG00000243485.2   lincRNA NOVEL   MIR1302-11  lincRNA NOVEL   MIR1302-11

【问题讨论】：

请从每个文件中发布一行，并在输出文件中发布相应的所需行。用什么分隔列？
好吧，这太过分了。你试过用谷歌搜索什么吗？你有自己的代码吗？甚至一行打开一个文件？从文件中读取行？将一行写入文件？当你有这些时，我们可以谈谈。
我觉得 OP copy-pasted an email reply

标签： python file join

【解决方案1】：

import csv

with open('path/to/file1') as infile1, open('path/to/file2') as infile2, open('path/to/output', 'w') as outfile:
    writer = csv.writer(outfile, delimiter='\t')
    for row1,row2 in zip(csv.reader(infile1, delimiter='\t'), csv.reader(infile2, delimiter='\t')):
        writer.writerow(row1+row2)

【讨论】：

@ali：这正是我发表评论以澄清您的原始帖子的原因。请解决这个问题，否则我无法提供超准确的答案
@ali：我已经更新了我的答案，完全符合您的需要

【解决方案2】：

试试这样：

with open('file1') as f1, open('file2') as f2, open('outfile','w') as out:
    for x in f1:
        y = next(f2)
        out.write("{}\t{}".format(x.strip(),y))

如果您在上面遇到错误，请尝试这样：

f1 = open('file1') 
f2 = open('file2')
out = open('outfile','w')
for x in f1:
    y = next(f2)
    out.write(x.strip() + "\t" + y)

【讨论】：

我喜欢它，但这仅适用于 OP 的文件以空格分隔的情况，这与我所做的假设相似。这个问题真的不是很清楚
@Hackaholic 我的文件是标签限制的
给出这个错误：SyntaxError: invalid syntax and it is related to "," after f1
with open('fisrts.txt') as f1, open('eights.txt') as f2, open('outfile.txt','w') as out: ^ SyntaxError: invalid语法
@ali 查看下一个版本的解决方案