在 CGI 脚本中运行 perl 脚本答案

【问题标题】：Run perl script inside CGI script在 CGI 脚本中运行 perl 脚本
【发布时间】：2015-05-27 19:08:12
【问题描述】：

我是生物信息学的新手，但我知道 perl 脚本。我编写了一些用于解析 pdb 文件（蛋白质晶体结构文件）的脚本。现在我想在 Web 服务器中运行这些。我在我的 ubuntu 中安装了 apache2。我已经阅读了有关 CGI 的一些内容，并且位于本地 Web 服务器的 /usr/lib/cgi-bin/ 中。我需要在那个目录中有我所有的 perl 脚本。这些脚本从命令行ex: perl contacts.pl pdbFile.pdb 获取输入。

现在我如何在 perl CGI 脚本中运行这些脚本，以便 CGI 脚本即时抛出 html 页面并要求用户输入（我猜这包括 PHP）。最后，我应该有一个能够在用户输入时运行我的 perl 脚本 (contacts.pl) 的 html 页面。

如果无法在html 网页中运行我的 perl 脚本，还有什么替代方案？

任何帮助将不胜感激。

【问题讨论】：

这里不需要 PHP，使用 PERL 进行 Web 开发已经在数百个在线教程和数十本书籍中进行了介绍。
难道不能在 CGI perl 脚本中运行我的 perl 代码吗？
当然是。你只需要读一点，看看所有的部分是如何组合在一起的。
我已经为这个..但是我发现了很多..你能不能给我一个我容易理解的地址，因为我来自生物学我想知道哪个最好选择为我服务
您必须阅读有关 HTML 表单、Apache CGI 配置和使用 perl 生成 HTML 页面（可能使用 CGI.pm）的内容。您需要一个包含 <form action="contacts.pl"> 元素的 HTML 页面，您可以在此处收集用户输入。当用户单击提交时，Web 浏览器将输入数据发送到 Web 服务器。启用 CGI 的服务器，运行表单的 action 属性中指定的脚本并将此数据传递给它。该脚本使用输入执行您想要的操作，并生成一个 HTTP 响应，该响应作为对表单提交的响应发送到浏览器。这些是使用 CGI 生成动态内容所涉及的步骤。

标签： apache perl cgi

【解决方案1】：

我不认为我会通过 CGI 运行所有内容。如果我是你，我会考虑使用 perl web 框架来处理生成网页和（大概）上传文件，然后调用你现有的代码来解析 pdb 文件并获取你感兴趣的任何内容。

一些流行的框架：

欢快：http://mojolicio.us/
舞者：http://perldancer.org/

至于运行网络服务器，他们应该有带有 apache 说明的部署指南。或者使用其他可以轻松运行 perl webapps 的网络服务器，例如 starman。

【讨论】：

【解决方案2】：

首先，您可以从以下链接获得基本想法：

Perl/CGI script with Apache2

CGI script calling a perl script

First Perl CGI script

【讨论】：