【问题标题】:How to find parameters of an optimization function by using scipy?如何使用 scipy 查找优化函数的参数?
【发布时间】:2016-05-26 12:40:49
【问题描述】:

我正在尝试复制这篇论文:Global motion estimation from coarsely sampled motion vector field and the applications

我需要找到参数m0, m1, m2....., m7 给定图像 x1_1 和 x1_2 以及方程式在哪里

Example data.

其中 x'{x1_2[1, :, :]} 和 y'{x1_2[0, :, :]} 是 x1_2 和 x, y x1_1 与 x1_1 风格相同。

我参考了this post 中的示例来进行此实现。

谁能帮我找到这些参数?

根据 cmets 和 example of leastsq function 进行编辑。

修改后的程序如下,输出如下

import os
import sys
import numpy as np
import scipy
from scipy.optimize import leastsq


def peval (inp_mat,p):
    m0,m1,m2,m3,m4,m5,m6,m7 = p
    out_mat = np.zeros(inp_mat.shape,dtype=np.float32)
    mid = inp_mat.shape[0]/2
    for xy in range(0,inp_mat.shape[0]):
        if (xy<(inp_mat.shape[0]/2)):
            out_mat[xy] = ( (  (inp_mat[xy+mid]*m0)+(inp_mat[xy]*m1)+ m2 ) /( (inp_mat[xy+mid]*m6)+(inp_mat[xy]*m7)+1 ) )
        else:
            out_mat[xy] = ( (  (inp_mat[xy]*m3)+(inp_mat[xy-mid]*m4)+ m5 ) /( (inp_mat[xy]*m6)+(inp_mat[xy-mid]*m7)+1 ) )
    return out_mat

def residuals(p, out_mat, inp_mat):
    m0,m1,m2,m3,m4,m5,m6,m7 = p
    err=np.zeros(inp_mat.shape,dtype=np.float32)
    if (out_mat.shape == inp_mat.shape):
        for xy in range(0,inp_mat.shape[0]):
            err[xy] =  err[xy]+ (out_mat[xy] -inp_mat[xy])
        return err




f = open('/media/anilil/Data/Datasets/repo/txt_op/vid.txt','r')
x = np.loadtxt(f,dtype=np.int16,comments='#',delimiter='\t')
nof = x.shape[0]/72 # Find the number of frames
x1 = x.reshape(-1,60,40)
x1_1= x1[0,:,:].flatten()
x1_2= x1[1,:,:].flatten()

x= []
y= []

for xy in range(1,50,1):
    y.append(x1[xy,:,:].flatten())
    x.append(x1[xy-1,:,:].flatten())

x=np.array(x,dtype=np.float32)
y=np.array(y,dtype=np.float32)
length =  x1_1.shape#initail guess
p0 = np.array([1,1,1,1,1,1,1,1],dtype=np.float32)

abc=leastsq(residuals, p0,args=(y,x))
print ('Size of first matrix is '+str(x1_1.shape))
print ('Size of first matrix is '+str(x1_2.shape))

print ("Done with program")

输出

ValueError: object too deep for desired array
Traceback (most recent call last):
  File "/media/anilil/Data/charm/mv_clean/.idea/nose_reduction_mpeg.py", line 49, in <module>
    abc=leastsq(residuals, p0,args=(y,x))
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/optimize/minpack.py", line 378, in leastsq
    gtol, maxfev, epsfcn, factor, diag)
minpack.error: Result from function call is not a proper array of floats.

【问题讨论】:

  • 你能分享你正在使用的数据吗?!
  • opt.leastsq 接受一个函数句柄,但在将它传递给leastsq 之前调用function()。删除 () 以传递函数本身,而不是先调用它:opt.leastsq(function, args=(), Dfun=...。这应该会使错误消息消失,但我不知道其他一切是否正确。
  • 分享了示例数据并尝试了“function”而不是“function()”@kazemakase
  • 啊,我错过了,首先。您还必须将x0 传递给函数:opt.leastsq(function, x0, args=(), ...。这些是您优化的参数m0...m7 的起始值(起始猜测)。这是非常特定于领域的,我不知道什么是好的值。您可以尝试 0,或者论文可以提示您从哪里开始。此外,inp_mat 听起来像是数据而不是优化参数。因此,我认为它不应该是函数参数。

标签: python numpy machine-learning scipy scikit-learn


【解决方案1】:

查看documentation of leastsqthe example

您需要定义目标函数,使其将所有参数作为第一个参数,然后是其他输入:

def function (M, inp_mat):
    m0, m1, m2, m3, m4, m5, m6, m7 = M
    out_mat = np.zeros(inp_mat.shape)
    ...

其他参数,在您的情况下为 inp_mat,作为 args 传递给优化函数:

result = opt.leastsq(function, x0, args=(inp_mat), Dfun=None, full_output=0, col_deriv=0, ftol=1.49012e-08, xtol=1.49012e-08, gtol=0.0, maxfev=0, epsfcn=None, factor=100, diag=None)

我不知道inp_mat 应该是什么。很可能它与数据有关,所以args=(x1) 可能是您想要的。

最后,您想从优化中检索结果并对其进行处理。

【讨论】:

  • 我根据示例做了一些更改。但是这里好像还是有错误。
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