不断报错库版本不兼容 libchtslib.so 需要 9.0.0 或更高版本，但 libcurl.4.dylib 提供 7.0.0 版本答案

【问题标题】：Keep getting error incompatible library version libchtslib.so requires version 9.0.0 or later, but libcurl.4.dylib provides version 7.0.0不断报错库版本不兼容 libchtslib.so 需要 9.0.0 或更高版本，但 libcurl.4.dylib 提供 7.0.0 版本
【发布时间】：2017-05-21 13:19:53
【问题描述】：

我正在尝试安装一个名为 metaBIT 的程序。我能够将它添加到我的 PATH 中。但是当我执行时：

metaBIT -h

它出错并给了我这个：

Traceback (most recent call last):
File "/Users/twpierson/edirect/metaBIT", line 12, in <module>
import pysam
File "//anaconda/lib/python2.7/site-packages/pysam/__init__.py", line 5, in       <module>
from pysam.libchtslib import *
ImportError: dlopen(//anaconda/lib/python2.7/site-  packages/pysam/libchtslib.so, 2): Library not loaded: libcurl.4.dylib
 Referenced from: //anaconda/lib/python2.7/site-packages/pysam/libchtslib.so
 Reason: Incompatible library version: libchtslib.so requires version 9.0.0    or later, but libcurl.4.dylib provides version 7.0.0

我已经使用谷歌搜索尝试了关于此错误的所有可用建议。

我尝试卸载并重新安装 pysam。

pip uninstall pysamp 
pip install pysam

我仍然遇到同样的错误。请帮忙！

【问题讨论】：

标签： python macos terminal pip pysam

【解决方案1】：

我建议安装 cURL 的 MacPorts 或 Homebrew 版本：

$ sudo port install curl

这将使用/opt/local/bin/curl 中的MacPorts 安装最新版本的cURL（此时为7.52.1）。 MacPorts 应该完成在 macOS/OS X 上使用此最新版本 cURL 所需的所有链接。安装后，您可以通过以下方式检查 libcurl.4.dylib 版本：

$ cd /opt/local/lib
$ otool -L libcurl.4.dylib
libcurl.4.dylib:
    /opt/local/lib/libcurl.4.dylib (compatibility version 9.0.0, current version 9.0.0)
    /opt/local/lib/libssl.1.0.0.dylib (compatibility version 1.0.0, current version 1.0.0)
    /opt/local/lib/libcrypto.1.0.0.dylib (compatibility version 1.0.0, current version 1.0.0)
    /opt/local/lib/libz.1.dylib (compatibility version 1.0.0, current version 1.2.8)
    /usr/lib/libSystem.B.dylib (compatibility version 1.0.0, current version 1238.0.0)

【讨论】：

@user3105519：是的，请按照此处的安装说明进行操作：macports.org/install.php。我会推荐“macOS Package (.pkg) Installer”方法，这是迄今为止最简单的方法（只需几分钟）。
很抱歉，但经过进一步检查，该解决方案仅在我位于 /opt/local/lib 目录时才有效。如果我切换目录，那么 curl 会再次损坏。请帮忙。谢谢！
@user3105519：/opt/local/lib 在您的路径中吗？通过 echo $PATH 检查它。还要检查您的系统正在使用哪个版本的 cURL...
Curl 7.0.0 我认为系统 curl 似乎在 /opt/local/bin/curl 中。我想我需要编辑 bash 配置文件并将 /opt/local/lib 移动到 /opt/local/bin/curl 之前？
这是我的 echo $PATH: /opt/local/bin:/opt/local/sbin:/opt/local/bin:/opt/local/sbin:/Users/Bobby/.local ://anaconda/bin:/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.4/bin:/Users/Bobby/.local/bin:/Users/Bobby/Desktop/Bob/metabit/KronaTools-2.7/scripts:/用户/Bobby/Desktop/Bob/metabit/samtools:/anaconda/pkgs/bowtie2-2.2.8-py27_2/bin:/opt/local/lib:/opt/blast-2.2.22/bin:/usr/bin: /bin:/usr/sbin:/sbin:/usr/local/bin:/opt/X11/bin:/Users/Bobby/Desktop/bowtie2-2.2.3:/Users/Bobby/Desktop/bowtie-2.2.3 :/Users/Bobby/edirect

【解决方案2】：

以下是我的解决方法：

      `conda remove bcftools` 
      `conda update curl`
      `conda install bcftools`

【讨论】：