GraphViz Dot 生成时间很长答案

【问题标题】：GraphViz Dot very long duration of generationGraphViz Dot 生成时间很长
【发布时间】：2012-06-01 17:25:18
【问题描述】：

我有一个希望由 Dot 生成的树形结构。每个节点有 4 条边到另外 4 个节点。总共有大约 1,000 个节点。如果我尝试使用 Dot 生成它，它需要很长时间（一旦我让它工作了一个小时 - CPU 使用率一直是 100%，但它没有完成）。有没有办法加速这个？也许通过设置质量？或者使用另一个（更快？）可视化软件？我已附上我的 Dot 文件供您在自己的机器上进行测试。

谢谢。点文件：http://lh.rs/3fmsfjmbvRw2

【问题讨论】：

我相信 dot 是所有 graphviz 布局引擎中最慢的。您是否尝试过使用其他任何一种？见路线图@graphviz.org

标签： performance tree graphviz dot duration

【解决方案1】：

查看此链接，laying out a large graph with graphviz

sfdp -x -Goverlap=scale -Tpng data.dot > data.png

【讨论】：

overlap=scale 是我在非常大的图表中解决问题的唯一选择 :) 谢谢！

【解决方案2】：

您可能想尝试设置此处提到的 nslimit 或 nslimit1 属性：

您还可以调整maxiter、mclimit 和splines 属性，尤其是splines=line 给了我一个巨大的加速（虽然有点丑）。

此外，正如 E-man 所建议的，dot 确实比 e.g. 慢。 circo 或 twopi，因此您可以考虑使用其中之一，如果它们看起来适合您的图表。

【讨论】：

【解决方案3】：

将大型 .dot 文件导入 Gephi - https://gephi.org 非常快。

【讨论】：

我试图在 gephi 中打开一个大的 .dot 文件，但它是空的。有没有机会给我举个例子？
嗨@Patrick，不幸的是我自己没有做太多的工作，也没有任何示例文件。您的点文件可能太复杂了。 Gephi 网站（不幸的是）提到：“Gephi 目前不提供对 DOT 格式的完整支持。不支持子图，也不支持自定义属性或大小。如果存在，只导入标签和颜色。支持有向图和无向图。 " - gephi.org/users/supported-graph-formats/graphviz-dot-format
谢谢吉姆。我认为我的 DOT 格式确实有子图，所以 Gephi 不适合它。