创建图像堆栈并写入 GDF 文件

【问题标题】：Creating Image stacks and writing GDF file创建图像堆栈并写入 GDF 文件
【发布时间】：2014-09-16 11:50:41
【问题描述】：

我正在尝试编写一个函数，将一系列图像堆叠到图像堆栈中并将其转换为 gdf 文件。我对 GDF 文件了解不多，所以请帮帮我。

X=[];

for i=1:10

    if numel(num2str(i))==1
    X{i}=imread(strcat('0000',num2str(i),'.tif'));
    elseif numel(num2str(i))==2
    X{i}=imread(strcat('000',num2str(i),'.tif'));
    end
end

myImage=cat(3,X{1:10});
s=write_gdf('stack.gdf',myImage);

以上是读取我标记为 00001 到 00010 的图像，全部为灰度。除了最后一行，一切都很好

s=write_gdf('stack.gdf',myImage);

当我运行它时，我收到一个错误：

Data type uint8 not supported

对这意味着什么有任何帮助吗？我应该将其转换为其他颜色格式吗？提前谢谢！

【问题讨论】：

标签： image matlab image-processing colors

【解决方案1】：

我会这样写代码（我没有write_gdf 函数，所以我无法正确测试代码）：

NumberOfFiles = 10;
X={};                 % preallocate CELL array
for n=1:NumberOfFiles % do not use "i" as your varable because it is imaginary unit in MatLab
    FileName = sprintf('%05d.tif',n);
    img      = imread(FileName); % load image
    X{i}     = double(img);      % and convert to desired format
end
myImage = cat(3,X{1:NumberOfFiles});
s = write_gdf('stack.gdf',myImage);

请记住

double(img);      % and convert to desired format

不会改变数据范围。如果它在磁盘上是uint8 格式，那么即使是double 格式的图像，其数据范围也将从0 到255。如果您需要将数据标准化为 0..1 范围，您应该这样做

X{i} = double(img)/255;

或更通用的形式

X{i} = double(img) / intmax(class(img));

【讨论】：