【发布时间】:2015-10-06 22:00:33
【问题描述】:
我正在制作一个图,其中 pvalue 使用 geom_text 绘制为文本。 pvalues 在文件pvaluesmir21combined 中给出。
如果值
ggplot(TumorNormalmiR21_5p.m3, aes(X2,value)) +
geom_dotplot(aes(fill=variable),binaxis = "y") + coord_flip() +
theme_bw(base_size=8) +
theme(axis.text.y=element_text(hjust = 0)) +
geom_text(aes(x, y, label=FDR, group=NULL),data=pvaluesmir21combined,size=2)
> pvaluesmir21combined
FDR x y
1 p = 8.3e-02 1 13
2 p = 6.3e-05 2 13
3 p = 3.2e-17 3 13
4 p = 4.8e-22 4 13
5 p = 3.1e-10 5 13
6 p = 6.7e-11 6 13
7 p = 3.2e-24 7 13
8 p = 2.1e-06 8 13
9 p = 1.9e-02 9 13
10 p = 9.4e-06 10 13
11 p = 1.5e-03 11 13
【问题讨论】:
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将颜色向量指定为
element_text。见stackoverflow.com/questions/20609716/… -
类似
geom_text(aes(x, y, label=FDR, group=NULL, colour=ifelse(as.numeric(sub("p = ", "", FDR)) < 5e-02 , "red", "black")),data=pvaluesmir21combined,size=2)。 -
成功了。然而,它们变成了红色和绿松石色。
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你应该使用
scale_color_manual或任何其他函数来选择颜色