在绘图和大小中包含 NA 值，填充图例

Question

我在数据集中有 NA 值，我想将其包含在我的 ggplot 以及图例中。我认为这可以通过指定 na.values="somecolour" 选项轻松完成，如图所示，例如在this 帖子中。但是，对于我的示例，代码运行时没有绘制任何 NA，也不包括图例中的条目。相反，具有缺失值的行会被自动删除。以下是一些说明代码：

set.seed(42)  
lat <- rnorm(10, 54, 12)
long <- rnorm(10, 44, 12)
val <- rnorm(6, 10, 3)
val <- c(val,NA,NA,NA,NA)

df <- as.data.frame(cbind(long, lat, val))

library(ggplot2)
library(scales)

ggplot() +
  geom_point(data=df, aes(x=lat, y=long, size=val, fill=val),shape=21,alpha=0.6) +
  scale_size_continuous(range = c(2, 12), breaks=pretty_breaks(4)) +
  scale_fill_distiller(direction = -1, palette="RdYlBu", breaks=pretty_breaks(4),na.value = "black") +     
  guides(fill = guide_legend(), size = guide_legend()) +
  theme_minimal()

我做错了什么？

Answer 1

问题来自在aes 中设置size，因为您无法在scale_size_continuous 中设置NA 值的大小。

我的解决方案是分别绘制 NA 值（不完美，但有效）。要将它们添加到图例中，请在 aes 中设置一些虚拟值以调用那里的指南。

但是，NA 图例与非 NA 图例不能很好地对齐存在一个问题。要调整对齐方式，我们必须绘制另一组不可见的 NA 值，其大小为最大非 NA 值。

ggplot(df, aes(lat, long, size = val, fill = val)) +
    geom_point(shape = 21,alpha = 0.6) +
    geom_point(data = subset(df, is.na(val)), aes(shape = "NA"),
               size = 1, fill = "black") +
    geom_point(data = subset(df, is.na(val)), aes(shape = "NA"),
               size = 14, alpha = 0) +
    scale_size_continuous(range = c(2, 12), breaks = pretty_breaks(4)) +
    scale_fill_distiller(direction = -1, palette = "RdYlBu", breaks = pretty_breaks(4)) +     
    labs(shape = "         val\n",
         fill = NULL,
         size = NULL) +
    guides(fill = guide_legend(), 
           size = guide_legend(),
           shape = guide_legend(order = 1)) +
    theme_minimal() +
    theme(legend.spacing.y = unit(-0.4, "cm"))

PS：需要ggplot2_3.0.0。