R中基线的设置范围

【问题标题】：Setting range for baseline in RR中基线的设置范围
【发布时间】：2020-10-03 01:30:57
【问题描述】：

我正在使用 R 中的基线包，并且正在阅读文档。他们的示例代码生成以下图像。

data(milk)
bc.irls <- baseline(milk$spectra[1,, drop=FALSE])
plot(bc.irls)

在我的例子中，x 刻度不应该从 0 开始，而是从 5000 开始（所以 x 轴的注释偏离了 5000）。是否可以更改基线构造函数中的范围？或者我可以以某种方式调整绘图方法中的 x 标签吗？

【问题讨论】：

标签： r plot package spectrum baseline

【解决方案1】：

根据文档，baseline 是一个 S4 类，具有访问器方法 getCorrected，它返回一个矩阵。

在您的示例中，此矩阵有单行和 21,452 列。因此，您可以将其转换为向量并删除前 4999 个元素，以获得从 5000 开始的光谱。您还需要创建一个 5,000 到 21,452 的序列作为 x 轴值。然后，您可以像绘制任何其他 x、y 向量一样绘制：

new_spec <- as.vector(getCorrected(bc.irls))
new_spec <- new_spec[5000:length(new_spec)]
new_x <- seq_along(new_spec) + 4999
plot(new_x, new_spec, type = "l", main = "Baseline corrected spectrum")

【讨论】：