使用 XML 包将 TCX 导入 R答案

【问题标题】：Import TCX into R using XML package使用 XML 包将 TCX 导入 R
【发布时间】：2012-01-07 00:03:57
【问题描述】：

我正在尝试使用 XML 包将 GPS 运行数据从 TCX 文件导入 R。这是我拥有的数据的一个小样本（只有 3 个跟踪点，而不是 ~900 个）

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<TrainingCenterDatabase xmlns:xs="http://www.w3.org/2001/XMLSchema" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns="http://www.garmin.com/xmlschemas/TrainingCenterDatabase/v2">
<Activities>
    <Activity Sport="Running">
        <Id>2011-10-30T16:05:48Z</Id>
        <Lap StartTime="2011-10-30T16:05:48Z">
            <TotalTimeSeconds>3855.99</TotalTimeSeconds>
            <DistanceMeters>12498.8115</DistanceMeters>
            <MaximumSpeed>4.45662498</MaximumSpeed>
            <Calories>1011</Calories>
            <Intensity>Active</Intensity>
            <TriggerMethod>Manual</TriggerMethod>
            <Track>
                <Trackpoint>
                    <Time>2011-10-30T16:05:48Z</Time>
                    <Position>
                        <LatitudeDegrees>52.33613318</LatitudeDegrees>
                        <LongitudeDegrees>-1.58814317</LongitudeDegrees>
                    </Position>
                    <AltitudeMeters>77.5234375</AltitudeMeters>
                    <DistanceMeters>0.00000000</DistanceMeters>
                </Trackpoint>
                <Trackpoint>
                    <Time>2011-10-30T16:05:49Z</Time>
                    <Position>
                        <LatitudeDegrees>52.33614810</LatitudeDegrees>
                        <LongitudeDegrees>-1.58814283</LongitudeDegrees>
                    </Position>
                    <AltitudeMeters>77.5234375</AltitudeMeters>
                    <DistanceMeters>1.77584004</DistanceMeters>
                </Trackpoint>
                <Trackpoint>
                    <Time>2011-10-30T16:05:54Z</Time>
                    <Position>
                        <LatitudeDegrees>52.33627098</LatitudeDegrees>
                        <LongitudeDegrees>-1.58818323</LongitudeDegrees>
                    </Position>
                    <AltitudeMeters>76.0814209</AltitudeMeters>
                    <DistanceMeters>15.7694969</DistanceMeters>
                </Trackpoint>
            </Track>
        </Lap>
    </Activity>
</Activities>
</TrainingCenterDatabase>

我正在尝试使用

读取跟踪点

doc = xmlParse("filetest.tcx")
xmlToDataFrame(nodes = getNodeSet(doc, "//Trackpoint"))

但是这失败了，结果是一个空的数据框。但是我发现如果我删除

 xmlns:xs="http://www.w3.org/2001/XMLSchema" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns="http://www.garmin.com/xmlschemas/TrainingCenterDatabase/v2"

从文件开头的 TrainingCenterDatabase 标记，此导入按预期正确运行。 IE。使用以下数据：

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<TrainingCenterDatabase>
    <Activities>
        <Activity Sport="Running">
            <Id>2011-10-30T16:05:48Z</Id>
            <Lap StartTime="2011-10-30T16:05:48Z">
                <TotalTimeSeconds>3855.99</TotalTimeSeconds>
                <DistanceMeters>12498.8115</DistanceMeters>
                <MaximumSpeed>4.45662498</MaximumSpeed>
                <Calories>1011</Calories>
                <Intensity>Active</Intensity>
                <TriggerMethod>Manual</TriggerMethod>
                <Track>
                    <Trackpoint>
                        <Time>2011-10-30T16:05:48Z</Time>
                        <Position>
                            <LatitudeDegrees>52.33613318</LatitudeDegrees>
                            <LongitudeDegrees>-1.58814317</LongitudeDegrees>
                        </Position>
                        <AltitudeMeters>77.5234375</AltitudeMeters>
                        <DistanceMeters>0.00000000</DistanceMeters>
                    </Trackpoint>
                    <Trackpoint>
                        <Time>2011-10-30T16:05:49Z</Time>
                        <Position>
                            <LatitudeDegrees>52.33614810</LatitudeDegrees>
                            <LongitudeDegrees>-1.58814283</LongitudeDegrees>
                        </Position>
                        <AltitudeMeters>77.5234375</AltitudeMeters>
                        <DistanceMeters>1.77584004</DistanceMeters>
                    </Trackpoint>
                    <Trackpoint>
                        <Time>2011-10-30T16:05:54Z</Time>
                        <Position>
                            <LatitudeDegrees>52.33627098</LatitudeDegrees>
                            <LongitudeDegrees>-1.58818323</LongitudeDegrees>
                        </Position>
                        <AltitudeMeters>76.0814209</AltitudeMeters>
                        <DistanceMeters>15.7694969</DistanceMeters>
                    </Trackpoint>
                </Track>
            </Lap>
        </Activity>
    </Activities>
</TrainingCenterDatabase>

我得到了我想要的数据框：（除了位置没有被分成纬度和经度之外，但我预计我应该能够处理这个问题，除非有人可以建议一种更简单的方法来直接使用 XPath 来做到这一点?)

> xmlToDataFrame(nodes = getNodeSet(doc, "//Trackpoint"))
                  Time               Position AltitudeMeters DistanceMeters
1 2011-10-30T16:05:48Z 52.33613318-1.58814317     77.5234375     0.00000000
2 2011-10-30T16:05:49Z 52.33614810-1.58814283     77.5234375     1.77584004
3 2011-10-30T16:05:54Z 52.33627098-1.58818323     76.0814209     15.7694969

显然，我不想从我要导入的任何文件中手动删除它。是不是我做错了什么（可能是 XPath？）这阻止了它的工作，或者是否有解决方法从 XML 数据中删除该部分？

非常感谢

【问题讨论】：

标签： xml r xpath import

【解决方案1】：

这是一个命名空间问题。就这样做

xmlToDataFrame(nodes <- getNodeSet(doc, "//ns:Trackpoint", "ns"))

要直接获取经纬度分割的位置，可以这样做

nodes <- getNodeSet(doc, "//ns:Trackpoint", "ns")
mydf  <- plyr::ldply(nodes, as.data.frame(xmlToList))
setNames(mydf, c('time', 'lat', 'long', 'alt', 'distance'))

它给了

                  time         lat        long        alt   distance
1 2011-10-30T16:05:48Z 52.33613318 -1.58814317 77.5234375 0.00000000
2 2011-10-30T16:05:49Z 52.33614810 -1.58814283 77.5234375 1.77584004
3 2011-10-30T16:05:54Z 52.33627098 -1.58818323 76.0814209 15.7694969

【讨论】：