【发布时间】:2020-06-30 14:43:44
【问题描述】:
目前我正在向 C 介绍自己以扩展我的 R 函数。我用 C 语言编写了一个函数来进行一些计算,它们运行良好。但是,一旦我在 R 本身中编写了一个包装器,似乎就会出现一些错误。 将我的 C 函数视为“colV”,将“abc”视为某个任意矩阵。
语句 (R) .Call("colV", abc, ncol(abc), nrow(abc)) 工作正常(每次,无论我使用它的频率如何),而
colV = function(x){
nc = ncol(x)
nr = nrow(x)
.Call("colV", x, nc, nr)
}
在第三次使用时提供错误的结果:
> colV(abc)
[1] 1.4274933 0.6254796 0.6774042 1.7094617 0.7250386
> colV(abc)
[1] 1.4274933 0.6254796 0.6774042 1.7094617 0.7250386
> colV(abc)
[1] -8.370087e+22 6.254796e-01 6.774042e-01 1.709462e+00 7.250386e-01
如果我再次声明包装器,前两次运行正常,第三次尝试再次出现相同的结果。请注意,除了外观之外,实际上只有第一个值发生了变化!
有人知道包装器有什么问题吗?如前所述,如果我只使用 .Call 语句,则始终返回正确的结果:
> .Call("colV", abc, ncol(abc), nrow(abc))
[1] 1.4274933 0.6254796 0.6774042 1.7094617 0.7250386
> .Call("colV", abc, ncol(abc), nrow(abc))
[1] 1.4274933 0.6254796 0.6774042 1.7094617 0.7250386
> .Call("colV", abc, ncol(abc), nrow(abc))
[1] 1.4274933 0.6254796 0.6774042 1.7094617 0.7250386
> .Call("colV", abc, ncol(abc), nrow(abc))
[1] 1.4274933 0.6254796 0.6774042 1.7094617 0.7250386
> .Call("colV", abc, ncol(abc), nrow(abc))
[1] 1.4274933 0.6254796 0.6774042 1.7094617 0.7250386
> .Call("colV", abc, ncol(abc), nrow(abc))
[1] 1.4274933 0.6254796 0.6774042 1.7094617 0.7250386
另外,我在使用 .C 接口时没有遇到过这个问题,但是由于速度和内存的原因,这对我来说不是一个解决方案。 提前致谢 艾琳
编辑:这是 C 代码:
#include <R.h>
#include <Rinternals.h>
#include <Rmath.h>
SEXP colV(SEXP y, SEXP n, SEXP r){
int *nc = INTEGER(n);
double *x = REAL(y);
int d = length(y);
int *nr = INTEGER(r);
int i, j, z;
//int d = nr * nc;
double colMean[(*nc)];
double xSq[(d)];
double colMsq[(*nc)];
double xSm[(*nc)];
SEXP result;
PROTECT(result = allocVector(REALSXP, (*nc)));
memset(REAL(result), 0, (*nc) * sizeof(double));
double *colVar = REAL(result);
//PROTECT(colVar = NEW_DOUBLE(nc));
int fr = ((*nr) - 1);
for(z = 0; z < (d); z++){
xSq[z] = x[z] * x[z];
}
for(i = 0; i < (*nc); i++){
for(j = 0; j < (*nr); j++){
colMean[i] += (x[(j + ((*nr) * i)) ]);
xSm[i] += (xSq[(j + (*nr * i))]);
}
colMean[i] = (colMean[i] / (*nr));
colMsq[i] = (*nr) * (colMean[i] * colMean[i]);
colVar[i] = ((xSm[i] - colMsq[i]) / fr);
}
UNPROTECT(1);
return(result);
}
【问题讨论】:
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是否也可以看到 C 代码,因为没有它,这不是 MWE,因为它无法复制。
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我可以提供它,我只是认为将其省略以提高可读性,因为直接调用 C 代码可以正常工作。但我会编辑它,没问题。
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但是,对于不同的 c 代码,我遇到了完全相同的问题。只需调用 c 函数即可提供准确/预期的结果,而包装它会产生废话。所以,如果有人对这个问题有答案,请告诉我们原因。