Fedora 21 上的 Openmpi

Question

我正在尝试使用“mpif90”在 Fedora 21 中编译一些代码。

首先我用'yum'安装openmpi：

[root@localhost Inversion]# yum install openmpi
Loaded plugins: langpacks
Package openmpi-1.8.3-2.fc21.x86_64 already installed and latest version
Nothing to do

但是当我使用'make'编译时它不起作用：

[root@localhost Inversion]# make all
mpif90 -O3 -c src/dispersion.f90
make: mpif90: Command not found
Makefile:18: recipe for target 'obj' failed
make: *** [obj] Error 127

如你所见，我已经下载了 openmpi 包，但它无法编译。

Answer 1

您无法编译，因为您没有加载必要的模块。

您需要加载环境模块，这就是 Fedora 在安装时处理 openmpi 的方式：

dnf install openmpi

（在 Fedora 25 中）

只需按照以下步骤操作：

1. 在您的终端中，执行以下操作：

   module avail
   

   您应该会看到类似这样的输出：

   --------------------- /usr/share/Modules/modulefiles ----------------------
   dot         module-git  module-info modules     null        use.own
   ---------------------------- /etc/modulefiles -----------------------------
   mpi/openmpi-x86_64
   

   请注意，mpi/openmpi-x86_64 模块可供您“加载”。

2. 在您的终端中，您只需：

   module load mpi/openmpi-x86_64
   

3. 现在您可以访问所有 mpi 编译器，例如 mpif90 和 mpic++ 等。您可以看到编译器二进制文件存储在：/usr/lib64/openmpi/bin：

   $ which mpif90 
   

   你会看到输出是：

   /usr/lib64/openmpi/bin/mpif90
   

Answer 2

dnf whatprovides "*/mpif90"

告诉你什么包提供了这个二进制文件。在 Fedora 中，您可以从 openmpi-devel 或 mpich 包中获取它。这么跑

yum install openmpi-devel

应该为你做这项工作。