我有一个正态分布图和一个直方图，其中 x 轴以对数刻度显示 0、10^0、10^1 ...我想在主要刻度之间包含次要刻度。实际上，我可以使用previous question 中提供的解决方案将主要刻度格式从 1、2、3 等更改为 10^0、10^1、10^2、10^3。我对主要刻度使用了以下代码：
major.ticks <- axTicks(1)
labels <- sapply(major.ticks,function(i)
as.expression(bquote(10^ .(i)))
)
axis(1,at=major.ticks,labels=labels)
是否可以对其进行编辑以仅标记次要刻度而不标记它们？
【问题讨论】：
StratigrapheR 包中有 minorAxis 函数，可用于任何类型的次要刻度。它可以与seq_log 函数一起使用来制作对数刻度：
library(StratigrapheR)
x <- exp(rnorm(200, 5))
hist(log10(x), 20, xaxt="n", xlim=c(0, 4), xlab = "x", main = "Logarithmic Histogram of x")
ticks <- seq_log(10^0,10^4, divide = T)
lab <- sapply(0:4, function(i) as.expression(bquote(10^ .(i))))
minorAxis(1, at.maj = log10(ticks[[1]]), at.min = log10(ticks[[2]]), labels = lab)
【讨论】：
10^a 格式（带有a 适当的指数）更好，这将是一个完整的答案。无论如何，请支持。
本页第一个图中的 x 轴标签有误。 次要刻度未正确分布。
【讨论】：
在ggplot2 中，我们可以将annotation_logticks 与scales::trans_breaks 和scales::trans_format 一起使用。以下是从上面的链接中获取的示例。
library(ggplot2)
a <- ggplot(msleep, aes(bodywt, brainwt)) +
geom_point(na.rm = TRUE) +
scale_x_log10(
breaks = scales::trans_breaks("log10", function(x) 10^x),
labels = scales::trans_format("log10", scales::math_format(10^.x))
) +
scale_y_log10(
breaks = scales::trans_breaks("log10", function(x) 10^x),
labels = scales::trans_format("log10", scales::math_format(10^.x))
) +
theme_bw()
a + annotation_logticks() # Default: log ticks on bottom and left
【讨论】：
有一个小错误，
lims<-lims[3:4] 不见了
minor.ticks.axis <- function(ax,n,t.ratio=0.5,mn,mx,...){
lims <- par("usr")
if(ax %in%c(1,3)) lims <- lims[1:2] else lims <- lims[3:4]
major.ticks <- pretty(lims,n=5)
if(missing(mn)) mn <- min(major.ticks)
if(missing(mx)) mx <- max(major.ticks)
major.ticks <- major.ticks[major.ticks >= mn & major.ticks <= mx]
labels <- sapply(major.ticks,function(i)
as.expression(bquote(10^ .(i)))
)
axis(ax,at=major.ticks,labels=labels,...)
n <- n+2
minors <- log10(pretty(10^major.ticks[1:2],n))-major.ticks[1]
minors <- minors[-c(1,n)]
minor.ticks = c(outer(minors,major.ticks,`+`))
minor.ticks <- minor.ticks[minor.ticks > mn & minor.ticks < mx]
axis(ax,at=minor.ticks,tcl=par("tcl")*t.ratio,labels=FALSE)
}
【讨论】：
这是一个简单的函数：
log10.axis <- function(side, at, ...) {
at.minor <- log10(outer(1:9, 10^(min(at):max(at))))
lab <- sapply(at, function(i) as.expression(bquote(10^ .(i))))
axis(side=side, at=at.minor, labels=NA, tcl=par("tcl")*0.5, ...)
axis(side=side, at=at, labels=lab, ...)
}
这是一个例子：
x <- exp(rnorm(200, 5))
hist(log(x), 20, xaxt="n", xlim=c(0, 8))
log10.axis(1, at=seq(0, 8, 2))
【讨论】：
tcl=par("tcl")*0.5 是一个很棒的技巧。在我看来，这比修改minor.tick 函数要简单得多
在包magicaxis 中尝试magaxis。
【讨论】：
Hmisc 包中有一个函数 minor.tick，但该函数对对数刻度的处理效果不佳。我使用以下函数来获取遵循对数刻度的小刻度。 ax 是您使用它的轴（与函数 axis 相同），n 是次要刻度的数量（默认为 9），t.ratio 是主要和次要刻度之间的比率，并且使用...，您可以将额外的参数传递给axis
edit : cmets 中的好主意，所以我编辑了我的函数。有两个额外的参数，mn 和 mx 用于对数刻度上的最小值和最大值（mn=0 因此表示最小值是 10^0 或 1！）
功能：
minor.ticks.axis <- function(ax,n,t.ratio=0.5,mn,mx,...){
lims <- par("usr")
if(ax %in%c(1,3)) lims <- lims[1:2] else lims[3:4]
major.ticks <- pretty(lims,n=5)
if(missing(mn)) mn <- min(major.ticks)
if(missing(mx)) mx <- max(major.ticks)
major.ticks <- major.ticks[major.ticks >= mn & major.ticks <= mx]
labels <- sapply(major.ticks,function(i)
as.expression(bquote(10^ .(i)))
)
axis(ax,at=major.ticks,labels=labels,...)
n <- n+2
minors <- log10(pretty(10^major.ticks[1:2],n))-major.ticks[1]
minors <- minors[-c(1,n)]
minor.ticks = c(outer(minors,major.ticks,`+`))
minor.ticks <- minor.ticks[minor.ticks > mn & minor.ticks < mx]
axis(ax,at=minor.ticks,tcl=par("tcl")*t.ratio,labels=FALSE)
}
这可以应用如下：
x <- 10^(0:8)
y <- 1:9
plot(log10(x),y,xaxt="n",xlab="x",xlim=c(0,9))
minor.ticks.axis(1,9,mn=0,mx=8)
给：
【讨论】：
graphics中的一个函数。
使用"" 作为次要刻度的标签。
【讨论】：