MPI 符号查找错误：opal_uses_threads

Question

所以：Ubuntu 17.04。直到昨天，MPI 一切正常，然后出了点问题。错误是标题上的错误，它以mpirun -n[n] ./myprogram 运行。
在 Opal 之前，错误出现在 Libmpi.so.12 上，尽管我尝试在我的 .bashrc 上指示 LD_LIBRARY_PATH，但我无法解决它，正如此处类似问题中所建议的那样.然后重新安装OpenMPI，这个新的错误已经改变，我不知道如何修复它。其实apt-file search libmpi.so的结果是：

lam4-dev: /usr/lib/lam/lib/libmpi.so
libopenmpi-dev: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/openmpi/lib/libmpi.so
libopenmpi2: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libmpi.so.20
libopenmpi2: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libmpi.so.20.0.2
libopenmpi2: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/openmpi/lib/libmpi.so.20.0.2

ldd 返回：

linux-vdso.so.1 =>  (0x00007ffc415e5000)
librt.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/librt.so.1 (0x00007fe717956000)
libmpi.so.12 => not found
libpthread.so.0 => /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0 (0x00007fe717738000)
libc.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007fe717371000)
/lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x000055ccd14f4000)

所以问题似乎仍然是 libmpi.so.12 ？重装OpenMPI之前有libmpi.so.12，MPI找不到，但是有。

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which mpirun 返回：

/usr/bin/mpirun

然后apt-file search mpicc 返回：

lam4-dev: /usr/bin/mpicc.lam
lam4-dev: /usr/share/man/man1/mpicc.lam.1.gz
libmpich-dev: /usr/bin/mpicc.mpich
libmpich-dev: /usr/share/man/man1/mpicc.mpich.1.gz
libopenmpi-dev: /usr/bin/mpicc.openmpi
libopenmpi-dev: /usr/share/man/man1/mpicc.openmpi.1.gz
libsimgrid-dev: /usr/bin/smpicc
libsimgrid-dev: /usr/share/man/man1/smpicc.1.gz
mpich-doc: /usr/share/doc/mpich-doc/www1/mpicc.html
openmpi-common: /usr/share/openmpi/mpicc-wrapper-data.txt
openmpi-common: /usr/share/openmpi/mpicc.openmpi-wrapper-data.txt

Answer 1

您的应用程序似乎是使用其他 MPI 版本（较旧的 Open MPI 或其他 MPI 库，例如 lam 或 mpich）构建的

最简单的方法是使用新安装的 Open MPI 重新构建您的应用程序

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这是在聊天中诊断出来的，根本原因是系统和用户构建的 Open MPI 不小心混在一起了。

一旦环境得到修复，因此只使用系统 Open MPI，问题就解决了。