如何编译 Fortran 代码以在 OpenMPI 中使用 gprof 进行分析？答案

【问题标题】：How to compile a Fortran code for profiling with gprof in OpenMPI?如何编译 Fortran 代码以在 OpenMPI 中使用 gprof 进行分析？
【发布时间】：2019-07-12 10:57:25
【问题描述】：

我能够使用 gfortran 编译器编译我的 Openmpi 代码。我给出的编译语法是：

mpif90 -o mycode.exe mycode.f90

mpirun -np 4 ./mycode.exe

它有效。现在我想使用 Gprof 分析我的代码。我知道我应该添加 -pg 标志，但如果我把它放在 mpif90 之后它会崩溃。我应该把国旗放在哪里？

【问题讨论】：

请说明您收到的确切错误消息以及您正在使用的完整命令行。
是的，这就是问题所在。我实际上不知道如何用 gprof 编译代码。如果我写“mpif90 -o -pg mycode.exe mycode.f90”，它不会给我可执行文件，而是创建一个名为“-pg”的文件。
-o 后面的是可执行文件的名称。尝试将 -pg 放在 -o 之前或 mycode.exe 之后。
显然分析输出都在一个文件中，除非您定义 GMON_OUT_PREFIX stackoverflow.com/a/30085788/3327666
你说它崩溃了。究竟发生了什么？您使用了哪些确切的命令？错误信息是什么？

标签： parallel-processing fortran gfortran openmpi gprof

【解决方案1】：

您可以尝试一下，看看效果如何。假设您使用的是 openmpi。将以下内容创建为名为 mywrapper.sh 的脚本

#!/bin/bash
prefix="gmon_${OMPI_COMM_WORLD_RANK}.out"
GMON_OUT_PREFIX=$prefix $*

并使用

运行您的代码

mpif90 -o mycode.exe -pg mycode.f90
mpirun -np 4 mywrapper.sh ./mycode.exe

分析 MPI 代码的测试代码（我使用的是 C，但 FORTRAN 应该可以正常工作）：

//file x.c
#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
int main(int argc, char *argv[])
{
    int rank=9;
    MPI_Init(&argc, &argv);
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
    printf("Hello from rank=%d!\n", rank);
    MPI_Finalize();
    return 0;
}

编译和运行测试的命令

#!/bin/bash
mpicc -pg x.c
mpirun --hostfile hostfile mywrapper.sh ./a.out

为了简单测试，hostfile 仅使用本地主机。命令输出：

Hello from rank=1!
Hello from rank=2!
Hello from rank=0!

然后你得到那些gprof文件，如果不能，一定是mpi配置问题。

.
├── a.out
├── gmon_0.out.2690
├── gmon_1.out.2692
├── gmon_2.out.2693

【讨论】：

它给出了错误：Open MPI 尝试通过“execve”系统调用创建一个新进程，但失败了。 Open MPI 在尝试启动子进程之前会检查很多东西，但没有什么是完美的。此错误可能表示目标主机上的另一个问题，或者甚至像为您的应用程序指定目录一样愚蠢。您的工作现在将中止。
刚试了一遍脚本，编辑错字，去掉“;”在脚本的第三行，它应该可以工作。如果 continue 有问题，我可以发布此示例的完整测试套件。
我又试了一次，还是一样的错误：“错误：执行格式错误”。如果您可以发布测试服，那将很有帮助。谢谢！
hostfile 的 localhost 名称是 3 倍