python glob.glob 不再工作，返回一个空列表

Question

我在一个非常奇怪的案例中运行......昨天我写了一个小脚本。它的目标是根据另一个文件检查文件中的一个条件。它按预期工作。但从今天早上开始，就没有了。据我所知，我没有改变任何东西。该代码不会引发任何错误。我认为罪魁祸首是 glob.glob

for file in glob.glob('*private.vcf.gz'):
    seen = False
    vcf = VCF(file)
    print("test")
    if not (file == "controlH.g.vcf.gz" or file == "output.g.vcf.gz"):
        sample_name = file.split('.')[0]
        out = "{}.FalsePositiveRefCallPurged.vcf".format(sample_name)
        w = Writer(out, vcf)
        for v in vcf:
            seen = False
            ref = VCF('output.g.vcf.gz')
            for r in ref:
                if seen :
                    break
                if not seen:
                    if v.CHROM == r.CHROM:
                        if v.start == r.start or v.start > r.start and v.start < r.end:
                            if r.FILTER == "RefCall":
                                continue#print(str(v))
                            else:
                                w.write_record(v)
                            seen = True
        w.close()

确实，当简单运行时

glob.glob('.*private.vcf.gz')

我得到一个空列表。 这是bash的输出

ls *.private.vcf.gz
D2A1.private.vcf.gz  D3A1.private.vcf.gz  D5B3.private.vcf.gz  H2C3.private.vcf.gz  H4C2.private.vcf.gz
D2B3.private.vcf.gz  D4A3.private.vcf.gz  H2A3.private.vcf.gz  H4A4.private.vcf.gz  H5A3.private.vcf.gz

所以我确定文件在那里......我真的不明白为什么突然 glob.glob 很难找到它们。

任何帮助将不胜感激，谢谢

Answer 1

好吧，看来是个目录

/.ipynb_checkpoints

已创建，我的笔记本使用它作为默认目录...