【问题标题】:How to Parallize the function fastly in Python 3.7?如何在 Python 3.7 中快速并行化函数?
【发布时间】:2020-07-18 06:00:43
【问题描述】:

我有一个包含 200 个 DataFrame 的列表,我正在尝试应用一个函数,但是。我正在尝试在 python 中应用并行函数来加快速度,但无法获得期望的结果。 下面是我的代码 data 是具有相同列和行但值不同的 DataFrame 列表

import pandas as pd
import multiprocessing as mp
   def maxloc(data): 
        data['loc_max'] = np.zeros(len(data))
        for i in range(1,len(data)-1):  
            if data['value'][i] >= data['value'][i-1] and data['value'][i] >= data['value'][i+1]:
                data['loc_max'][i] = 1
        return data  

    pool = mp.Pool(mp.cpu_count())
    results = pool.map(maxloc, [row for row in data])
    pool.close() 
    pool.join()

【问题讨论】:

  • scipy.signal.argrelextrema 可能对这项任务有帮助。它已经被矢量化了,因此应该很快。
  • @cel 谢谢,我怎样才能在这个中使用我自己的函数 maxloc?

标签: python python-3.x python-2.7 multiprocessing python-multiprocessing


【解决方案1】:

这是一个使用 scipy.signal.argrelextrema 的 maxloc 实现,并且速度要快得多(在本例中超过 1000 倍):

import pandas as pd
from scipy.signal import argrelextrema 
np.random.seed(42)

def maxloc(data): 
    data['loc_max'] = np.zeros(len(data))
    for i in range(1,len(data)-1):  
        if data['value'][i] >= data['value'][i-1] and data['value'][i] >= data['value'][i+1]:
            data['loc_max'][i] = 1
    return data 

def maxloc_faster(data):
    loc_opt_ind = argrelextrema(df.value.to_numpy(), np.greater)
    loc_max = np.zeros(len(data))
    loc_max[loc_opt_ind] = 1
    data['loc_max'] = loc_max
    return data

让我们测试一下

values = np.random.rand(10000)
df = pd.DataFrame({'value': values})
np.all(maxloc_faster(df).loc_max == maxloc(df).loc_max)
# True

%timeit maxloc(df)
# 672 ms ± 39.8 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

%timeit maxloc_faster(df)
# 268 µs ± 12.7 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)

【讨论】:

  • 谢谢,当我运行代码时,它给了我这个错误 loc_max[loc_opt_ind] = 1 IndexError: too many indices for array, As I used df.values to change DataFrame into array
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