R：写入具有不同行值的 CSV答案

【问题标题】：R : Write CSV that has varying row valuesR：写入具有不同行值的 CSV
【发布时间】：2016-10-06 20:10:16
【问题描述】：

我正在尝试从 R 写入一个 csv 文件，该文件具有不同数量的行值，

*for example*,
1,2,3,4,5
2,3,6
2,3
4,3,4,5

我尝试了 3 次可能的尝试，但都失败了。

我创建了一个包含 1 列的数据框，并将每个值用逗号分隔。但是，当我在编辑器中打开它时，它无法像普通的 csv 一样被处理，当我通过 read.table 将它导入 R 时存在问题@

forloop{

行

}

dataframe[i,]

2.我为不存在的值创建了一个缺失值 NA 的数据框，例如，

t  NA w e NA
NA NA t q NA

然后我以

的形式写入 csv

write.table(dataframe,file = "test.csv", row.names = FALSE , col.names = FALSE, na = "", quote = FALSE, sep = ",")

但是，对于 NA 值，我有不必要的 ,

将每一行推入一个向量并逐行写入 csv。

forloop{

row.temp

} write.table(temp,file = "test.csv", row.names = FALSE, col.names = FALSE, append=TRUE, sep = ",")

但是，问题是每个向量值都被写入每个新行。

我想用 R 格式创建这个 CSV 文件。我可以采取什么方法来解决这个问题。相信很多人都遇到过这个问题。谢谢！！

【问题讨论】：

我正在使用“arules”关联库，对于 read.transactions() 方法，它需要 CSV 数据具有该结构。我无法让具有 NA 值的 data.frame 工作，因为每个值都应该是唯一的（NA 是重复的）。
@anz 你在 R 中使用arules？你能粘贴你得到的错误吗？
对不起，我确实得到了使用方法 #2 识别 csv 的规则。我想要一个更干净的 csv 文件，并且我想避免为此使用另一种编程语言。稍后我将需要此 csv 数据的更简洁版本以进行发布和处理。我还没有正确验证，但我认为它有点慢。我确实通过使用 Java 操作 csv 文件尝试了一个更简洁的版本。

标签： r csv vector dataframe

【解决方案1】：

您是否尝试过使用cat？只需将你要的数据逐行直接写入输出文件即可。

fileOut <- file("output.txt")
apply(dataframe, 1, function(x) {
                       l <- paste0(x[!is.na(x)], collapse=",")
                       cat(l, file=fileOut, append=TRUE, sep = "\n")

                    })

请注意，我将append 模式设置为TRUE，以确保您不会在apply 的每次迭代期间覆盖上一行。

此解决方案假定数据框 dataframe 具有，正如您在上述尝试之一中所述，所有列中的 NA 值都是缺失值。在这种情况下，我的 sn-p 在写入文件之前删除了这些 NA 值。

【讨论】：

我想我只得到了数据框的最后一行。它似乎已经覆盖了之前的行。
@anz 由于某种原因，我也遇到了writeLines 的问题。切换到cat 似乎已经开始工作了。
即使有猫，它仍然只写最后一行。从 cat 文档中，附加逻辑。仅当参数文件是文件名（而不是连接或“|cmd”）时才使用。如果 TRUE 输出将附加到文件中；否则，它将覆盖文件的内容。
此代码在我测试时对我有用，并且我得到了符合您期望的 CSV 输出。听起来append=TRUE 模式在您的设置中不起作用。
好吧，追加在我这边没有用。但是我采用了与您类似的方法（如我原始帖子中的 #1 所述），创建一个字符串并将其输出到文件。我最初方法的问题是我在 paste0() 方法中连接了 "," 而不是使用 sep="," 。我想这会在文件编码和所有方面产生某种差异。我创建了一个包含所有这些字符串的数据框，并使用 write.table() 写入文件。有效。谢谢！！你当然帮我找到了让我烦了 5 个小时的 bug。干杯！！