热图一个字符矩阵答案

【问题标题】：Heatmap a chacrter matrix热图一个字符矩阵
【发布时间】：2013-12-12 03:06:50
【问题描述】：

我是 R 的新手，我想知道是否可以对包含 TRUE 和 FALSE 的表或矩阵进行热图，即：条件1 条件2。 . . Id1 真假 Id2 假真 . . . 我对这个幼稚问题的借口和任何提议都欢迎制作热图或任何工具，通过颜色代码可视化我的表格或矩阵，并基于它应用聚类或树状图。
提前谢谢你

【问题讨论】：

我发现了一个类似的问题HERE

标签： r heatmap

【解决方案1】：

假设您可以轻松地将 TRUE/FALSE 转换为 1,0 数字

x<-data.frame(y=sample(c(1, 0),10, replace=TRUE), z=sample(c(1, 0),10, replace=TRUE))
heatmap(as.matrix(x))

如果需要，将 TRUE/FALSE 更改为 1/0 ，

x[x==TRUE]<-1
x[x==FALSE]<-0

【讨论】：

其实你不需要把T转1或者F转0，它会自动完成的。
嗯，我得到以下错误 Error in heatmap(as.matrix(x)) : 'x' must be a numeric matrix 没有转换，可能是 image 没问题，但不是 heatmap
它会用as.numeric(x)做1和0

【解决方案2】：

使用 image() 函数：

> x=matrix(c(T,F,T,F,F,F,T,T,F,T,T,T,F,F,F,T),ncol=4)
> x
      [,1]  [,2]  [,3]  [,4]
[1,]  TRUE FALSE FALSE FALSE
[2,] FALSE FALSE  TRUE FALSE
[3,]  TRUE  TRUE  TRUE FALSE
[4,] FALSE  TRUE  TRUE  TRUE
> image(t(x),axes=F)
> axis(2,at=seq(0,1,(1/(nrow(x)-1))),labels=nrow(x):1)
> axis(3,at=seq(0,1,(1/(ncol(x)-1))),labels=1:ncol(x))

试一试！

【讨论】：

+1！但是，它不应该是image(t(x)[,ncol(x):1]) 吗？这些方块让我头疼！