eHOF 封装中的嵌套设计和 F、p 和 R² 值

Question

我想在 eHOF 包的 HOF 函数中考虑我的嵌套研究设计。 我们采样了嵌套在样本块中的点和嵌套在村庄中的点（随机）。

到目前为止，我使用 GLMM 来描述栖息地类型（栖息地、解释性、固定）对物种丰富度（SpR、响应变量、固定）的影响。因此我使用了 lme (of nlme-package) 我可以将嵌套学习设计合并到函数中：

model1<-lme(SpR~Habitat,random=~1|Village/Block,data=birds) # full model

现在我想描述沿梯度对 SpR 的影响。我的 HOF 函数如下所示：

hof.blocks<-HOF(SpR,Indexc,M=max(SpR),bootstrap=100,
                 family=poisson)

有没有办法在 HOF 中加入嵌套研究设计？

我也无法获得 P 值，也无法获得 F 或 R2 值。我是不是忽略了什么？

包装：eHOF 版本：1.4 R 版本 3.0.2

Answer 1

不，目前没有。您可以尝试使用nlme() 手动拟合非线性模型，也许在 eHOF 包代码中查找有关如何指定公式等的提示，但该包直接使用非线性优化器，而不是nlme()，因此您需要进行翻译工作以获得nlme 可以使用并计算出其他细节的模型公式。