如何将 Gmsh 生成的 3D 网格导入到 Fipy？

Question

我正在研究耦合 DEM-CFD 模型。我将 Fipy 用于其 CFD 部分，我的几何图形是圆柱体。如何将 Gmsh 中生成的网格导入 Fipy？

我需要生成一个圆柱几何体，并通过在 Fipy 中生成 3D 三角形网格对其进行离散化。我试图在 Fipy 的帮助下找到一个命令以在圆柱几何中生成 3D 三角形网格，但我找不到任何与 3D 相关的东西。我在 Gmsh 软件中生成了 Mesh，Fipy 基于它的帮助接受了它。我现在有网格文件，但我无法将它导入到 Fipy。

每当我尝试将其导入模型时，都会遇到此错误Gmsh version must be >= 2.0。但是，我的 Gmsh 版本是 4。

我也使用了 Gmsh V2.5，但错误是一样的。我搜索了错误，我发现有些人也在为此苦苦挣扎。他们建议将 Gmsh.exe 文件放在脚本文件夹中以解决问题。我已经这样做了，但我遇到了另一个错误。新的错误是

Windows Error: [Error 32] The process cannot access the file because it is being used by another process

当命令为mesh = fp.Gmsh3D("Cylinder.msh") 时。

我也搜索了这个错误，有人建议在网格之后提及几何文件，mesh = fp.Gmsh3D("Cylinder.msh, Cylinder.geo")。 现在，我得到了这个

GmshException: Gmsh hasn't produced any cells! Check your Gmsh code.

我试图制作圆形网格，它是一个圆形的 2D 三角形网格（它在 Fipy 帮助中），但我得到了这个

GmshException: Gmsh hasn't produced any cells! Check your Gmsh code

python scritp、column.msh、column.geo 和 Gmsh.exe 文件在同一个文件夹中。

错误：

File "C:\Users\jpethati\AppData\Local\Continuum\anaconda2\lib\site-packages\fipy\meshes\gmshMesh.py", line 809, in read
    raise GmshException(errStr)

GmshException: Gmsh hasn't produced any cells! Check your Gmsh code.

Gmsh 输出：

Info    : Running 'gmsh c:\users\jpethati\appdata\local\temp\tmpsw2tzg.geo -3 -nopopup -format msh -o c:\users\jpethati\appdata\local\temp\tmp6gbww9.msh' [Gmsh 4.2.2, 1 node, max. 1 thread] 
Info    : Started on Fri Mar 29 10:25:25 2019 
Info    : Reading 'c:\users\jpethati\appdata\local\temp\tmpsw2tzg.geo'... 
Info    : Done reading 'c:\users\jpethati\appdata\local\temp\tmpsw2tzg.geo' 
Info    : Meshing 1D... 
Info    : Done meshing 1D (0 s) 
Info    : Meshing 2D...
Info    : Done meshing 2D (0 s) 
Info    : Meshing 3D... 
Info    : Done meshing 3D (0 s) 
Info    : 0 vertices 0 elements 
Info    : Writing 'c:\users\jpethati\appdata\local\temp\tmp6gbww9.msh'... 
Info    : Done writing 'c:\users\jpethati\appdata\local\temp\tmp6gbww9.msh' 
Info    : Stopped on Fri Mar 29 10:25:25 2019

import fipy as fp

第一次尝试

mesh = fp.Gmsh3D("Cylinder.msh") 

第二次尝试

mesh = fp.Gmsh3D("Cylinder.msh, Cylinder.geo")

Answer 1

FiPy 3.3 解决了 Windows 上 Gmsh 的一些问题。如果仍有问题，请升级并告诉我们。