shap.force_plot() 引发异常：在 v0.20 中 force_plot 现在需要基值作为第一个参数答案

【问题标题】：shap.force_plot() raises Exeption: In v0.20 force_plot now requires the base value as the first parametershap.force_plot() 引发异常：在 v0.20 中 force_plot 现在需要基值作为第一个参数
【发布时间】：2019-11-09 11:29:01
【问题描述】：

我正在使用 Catboost 并希望可视化 shap_values：

from catboost import CatBoostClassifier
model = CatBoostClassifier(iterations=300)
model.fit(X, y,cat_features=cat_features)

pool1 = Pool(data=X, label=y, cat_features=cat_features)
shap_values = model.get_feature_importance(data=pool1, fstr_type='ShapValues', verbose=10000)

shap_values.shape
Output: (32769, 10)
X.shape
Output: (32769, 9)

然后我执行以下操作并引发异常：

shap.initjs()
shap.force_plot(shap_values[0,:-1], X.iloc[0,:])

例外：在 v0.20 中 force_plot 现在需要将基值作为第一个参数！尝试 shap.force_plot(explainer.expected_value, shap_values) 或多输出模型尝试 shap.force_plot(explainer.expected_value[0], shap_values[0])。

以下工作，但我想让 force_plot() 工作：

shap.initjs()
shap.summary_plot(shap_values[:,:-1], X)

我阅读了文档，但无法理解解释器。我试过了：

explainer = shap.TreeExplainer(model,data=pool1)
#Also tried:
explainer = shap.TreeExplainer(model,data=X)

但我得到：TypeError: ufunc 'isnan' not supported for the input types，并且根据强制转换规则 ''safe'' 无法安全地将输入强制转换为任何支持的类型

谁能指出我正确的方向？谢了

【问题讨论】：

标签： decision-tree xgboost lightgbm catboost

【解决方案1】：

试试这个：

shap.force_plot(explainer.expected_value, shap_values.values[0, :], X.iloc[0, :])

【讨论】：

【解决方案2】：

我遇到了与下面相同的错误-

例外：在 v0.20 中，force_plot 现在需要基值作为第一个参数！尝试 shap.force_plot(explainer.expected_value, shap_values) 或多输出模型尝试 shap.force_plot(explainer.expected_value[0], shap_values[0]).

这帮助我解决了问题-

import shap
explainer = shap.TreeExplainer(model,data=X)
shap.initjs()
shap.force_plot(explainer.expected_value[0],X.iloc[0,:])

也适用于以下问题-

TypeError: ufunc 'isnan' 不支持输入类型，并且输入无法安全地强制转换为任何支持的类型强制转换规则“安全”

检查您的数据是否包含任何 NaN 值或缺失值。
希望这会有所帮助！

【讨论】：