在 R 中使用 hclust 集群属性

Question

我有一个数据集，它是二维数据，列名作为属性，行作为项目。示例如下：

       A1    A2   A3   A4   ....
Item1  0     1     0    0
Item2  0     0     0    1
Item3  1    1      0    0

....

我已经使用 hclust（ward.D2 方法）在 R 中创建了一个集群树状图。我可以获得集群中所有项目的标签。如何找出集群的属性列表（A1 A2 等），以便推断这些项目是如何组合在一起的？

我试过的代码是：

d <- vegdist(data,method="jaccard")
fit <- hclust(d,method="ward.D2")
plot(fit)
hcd <- as.dendrogram(fit)
plot(cut(hcd,h=3)$upper)
labels(cut(hcd, h=3)$lower[[1]])

Answer 1

层次聚类不处理列。

它在距离矩阵上运行 - 不再有列标签。

您可能正在寻找双聚类。