在R中提取bz2文件答案

【问题标题】：Extract bz2 file in R在R中提取bz2文件
【发布时间】：2014-11-14 22:12:51
【问题描述】：

我有一堆 .csv.bz2 文件，我必须在 R 中下载、提取和阅读这些文件。我下载了文件并想将其解压缩到当前工作目录，然后阅读它。 unz(filename,filename.csv) 但它似乎不起作用。我该怎么做？

听说bzfiles不用解压就可以直接读取。我该怎么做？

【问题讨论】：

标签： r bzip2

【解决方案1】：

根据read.table的描述，可以直接读取a compressed file。

read.table("file.csv.bz2")

【讨论】：

【解决方案2】：

像这样：

readcsvbz2file <- read.csv(bzfile("file.csv.bz2"))

【讨论】：

bzfile()不是必须的，read.csv()可以自动处理压缩文件。所以它只是read.csv("file.csv.bz2")。 Here is an example（第一部分“加载数据”）。
bzipfile() 是一个更通用的解决方案，因为它对其他格式很有用。谢谢

【解决方案3】：

您可以使用内置支持 bz2 压缩文件的超快fread

require(data.table)
fread("file.csv.bz2")

【讨论】：

【解决方案4】：

您可以使用以下两个命令中的任何一个：

read.csv()command：使用此命令，您可以直接提供包含 csv 文件的压缩文件名。

read.csv("file.csv.bz2")
read.table() 命令：此命令是read.csv() 命令的通用版本。您可以设置分隔符和read.csv() 自动设置的其他选项。您不需要单独解压缩文件。此命令会自动为您执行。

read.csv("file.csv.bz2", header = TRUE, sep = ",", quote = "\"",...)

【讨论】：

【解决方案5】：

基本上，你需要输入：

library(R.utils)
bunzip2("dataset.csv.bz2", "dataset.csv", remove = FALSE, skip = TRUE)

dataset <- read.csv("dataset.csv")

在此处查看文档：bunzip2 {R.utils}。

【讨论】：